Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf394Q9Z1D9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf394Q9Z1D9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf394Q9Z1D9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf394Q9Z1D9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf394Q9Z1D9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf394Q9Z1D9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf394Q9Z1D9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf394Q9Z1D9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf394Q9Z1D9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf394Q9Z1D9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf394Q9Z1D9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf394Q9Z1D9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf394Q9Z1D9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf394Q9Z1D9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf394Q9Z1D9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf394Q9Z1D9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf394Q9Z1D9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf394Q9Z1D9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf394Q9Z1D9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf394Q9Z1D9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf394Q9Z1D9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf394Q9Z1D9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf394Q9Z1D9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf394Q9Z1D9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf394Q9Z1D9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf394Q9Z1D9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf394Q9Z1D9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf394Q9Z1D9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf394Q9Z1D9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf394Q9Z1D9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf394Q9Z1D9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf394Q9Z1D9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf394Q9Z1D9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf394Q9Z1D9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf394Q9Z1D9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf394Q9Z1D9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf394Q9Z1D9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf394Q9Z1D9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf394Q9Z1D9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf394Q9Z1D9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf394Q9Z1D9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf394Q9Z1D9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf394Q9Z1D9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf394Q9Z1D9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf394Q9Z1D9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf394Q9Z1D9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf394Q9Z1D9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Znf394Q9Z1D9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Znf394Q9Z1D9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf394Q9Z1D9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf394Q9Z1D9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf394Q9Z1D9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf394Q9Z1D9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf394Q9Z1D9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf394Q9Z1D9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf394Q9Z1D9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf394Q9Z1D9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf394Q9Z1D9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf394Q9Z1D9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf394Q9Z1D9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf394Q9Z1D9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf394Q9Z1D9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf394Q9Z1D9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf394Q9Z1D9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf394Q9Z1D9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf394Q9Z1D9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf394Q9Z1D9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf394Q9Z1D9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf394Q9Z1D9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf394Q9Z1D9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf394Q9Z1D9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf394Q9Z1D9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Znf394Q9Z1D9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Znf394Q9Z1D9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Znf394Q9Z1D9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf394Q9Z1D9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf394Q9Z1D9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf394Q9Z1D9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf394Q9Z1D9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf394Q9Z1D9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf394Q9Z1D9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf394Q9Z1D9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf394Q9Z1D9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf394Q9Z1D9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf394Q9Z1D9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf394Q9Z1D9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf394Q9Z1D9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf394Q9Z1D9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf394Q9Z1D9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf394Q9Z1D9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf394Q9Z1D9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf394Q9Z1D9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf394Q9Z1D9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf394Q9Z1D9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf394Q9Z1D9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf394Q9Z1D9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf394Q9Z1D9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf394Q9Z1D9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf394Q9Z1D9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.6 ms