Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC36,01■■■■□ 3,36
Setbp1Q9Z180 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,01■■■■□ 3,35
Setbp1Q9Z180 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3,35
Setbp1Q9Z180 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3,35
Setbp1Q9Z180 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3,35
Setbp1Q9Z180 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,99■■■■□ 3,35
Setbp1Q9Z180 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Setbp1Q9Z180 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC35,98■■■■□ 3,35
Setbp1Q9Z180 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Setbp1Q9Z180 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Setbp1Q9Z180 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC35,97■■■■□ 3,35
Setbp1Q9Z180 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
Setbp1Q9Z180 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
Setbp1Q9Z180 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
Setbp1Q9Z180 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
Setbp1Q9Z180 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,96■■■■□ 3,35
Setbp1Q9Z180 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,96■■■■□ 3,35
Setbp1Q9Z180 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,35
Setbp1Q9Z180 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,35
Setbp1Q9Z180 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,95■■■■□ 3,35
Setbp1Q9Z180 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,95■■■■□ 3,35
Setbp1Q9Z180 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC35,93■■■■□ 3,34
Setbp1Q9Z180 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC35,93■■■■□ 3,34
Setbp1Q9Z180 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
Setbp1Q9Z180 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
Setbp1Q9Z180 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Setbp1Q9Z180 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Setbp1Q9Z180 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC35,91■■■■□ 3,34
Setbp1Q9Z180 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,91■■■■□ 3,34
Setbp1Q9Z180 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,91■■■■□ 3,34
Setbp1Q9Z180 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,91■■■■□ 3,34
Setbp1Q9Z180 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,9■■■■□ 3,34
Setbp1Q9Z180 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35,89■■■■□ 3,34
Setbp1Q9Z180 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,89■■■■□ 3,34
Setbp1Q9Z180 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC35,89■■■■□ 3,34
Setbp1Q9Z180 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,89■■■■□ 3,34
Setbp1Q9Z180 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,89■■■■□ 3,34
Setbp1Q9Z180 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,88■■■■□ 3,33
Setbp1Q9Z180 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC35,88■■■■□ 3,33
Setbp1Q9Z180 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,88■■■■□ 3,33
Setbp1Q9Z180 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC35,88■■■■□ 3,33
Setbp1Q9Z180 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Setbp1Q9Z180 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Setbp1Q9Z180 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC35,86■■■■□ 3,33
Setbp1Q9Z180 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
Setbp1Q9Z180 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,85■■■■□ 3,33
Setbp1Q9Z180 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,85■■■■□ 3,33
Setbp1Q9Z180 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC35,85■■■■□ 3,33
Setbp1Q9Z180 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,85■■■■□ 3,33
Setbp1Q9Z180 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35,85■■■■□ 3,33
Setbp1Q9Z180 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,84■■■■□ 3,33
Setbp1Q9Z180 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,84■■■■□ 3,33
Setbp1Q9Z180 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC35,84■■■■□ 3,33
Setbp1Q9Z180 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC35,82■■■■□ 3,33
Setbp1Q9Z180 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC35,81■■■■□ 3,32
Setbp1Q9Z180 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC35,81■■■■□ 3,32
Setbp1Q9Z180 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,81■■■■□ 3,32
Setbp1Q9Z180 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35,81■■■■□ 3,32
Setbp1Q9Z180 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,81■■■■□ 3,32
Setbp1Q9Z180 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,81■■■■□ 3,32
Setbp1Q9Z180 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,8■■■■□ 3,32
Setbp1Q9Z180 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC35,79■■■■□ 3,32
Setbp1Q9Z180 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35,78■■■■□ 3,32
Setbp1Q9Z180 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC35,78■■■■□ 3,32
Setbp1Q9Z180 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,77■■■■□ 3,32
Setbp1Q9Z180 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC35,77■■■■□ 3,32
Setbp1Q9Z180 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC35,76■■■■□ 3,32
Setbp1Q9Z180 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,31
Setbp1Q9Z180 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC35,75■■■■□ 3,31
Setbp1Q9Z180 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC35,75■■■■□ 3,31
Setbp1Q9Z180 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,74■■■■□ 3,31
Setbp1Q9Z180 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,73■■■■□ 3,31
Setbp1Q9Z180 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,72■■■■□ 3,31
Setbp1Q9Z180 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,72■■■■□ 3,31
Setbp1Q9Z180 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC35,72■■■■□ 3,31
Setbp1Q9Z180 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC35,72■■■■□ 3,31
Setbp1Q9Z180 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,72■■■■□ 3,31
Setbp1Q9Z180 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35,72■■■■□ 3,31
Setbp1Q9Z180 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC35,71■■■■□ 3,31
Setbp1Q9Z180 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35,71■■■■□ 3,31
Setbp1Q9Z180 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC35,7■■■■□ 3,31
Setbp1Q9Z180 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC35,69■■■■□ 3,3
Setbp1Q9Z180 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,69■■■■□ 3,3
Setbp1Q9Z180 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC35,68■■■■□ 3,3
Setbp1Q9Z180 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC35,68■■■■□ 3,3
Setbp1Q9Z180 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,67■■■■□ 3,3
Setbp1Q9Z180 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,67■■■■□ 3,3
Setbp1Q9Z180 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
Setbp1Q9Z180 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,66■■■■□ 3,3
Setbp1Q9Z180 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,65■■■■□ 3,3
Setbp1Q9Z180 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,65■■■■□ 3,3
Setbp1Q9Z180 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,65■■■■□ 3,3
Setbp1Q9Z180 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC35,64■■■■□ 3,3
Setbp1Q9Z180 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,64■■■■□ 3,3
Setbp1Q9Z180 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,62■■■■□ 3,29
Setbp1Q9Z180 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,62■■■■□ 3,29
Setbp1Q9Z180 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,61■■■■□ 3,29
Setbp1Q9Z180 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,61■■■■□ 3,29
Setbp1Q9Z180 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,6■■■■□ 3,29
Setbp1Q9Z180 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56,3 ms