Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hmg20bQ9Z104 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hmg20bQ9Z104 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Hmg20bQ9Z104 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hmg20bQ9Z104 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hmg20bQ9Z104 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hmg20bQ9Z104 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Hmg20bQ9Z104 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hmg20bQ9Z104 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hmg20bQ9Z104 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hmg20bQ9Z104 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hmg20bQ9Z104 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hmg20bQ9Z104 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hmg20bQ9Z104 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hmg20bQ9Z104 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hmg20bQ9Z104 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hmg20bQ9Z104 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hmg20bQ9Z104 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hmg20bQ9Z104 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hmg20bQ9Z104 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hmg20bQ9Z104 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Hmg20bQ9Z104 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Hmg20bQ9Z104 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Hmg20bQ9Z104 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hmg20bQ9Z104 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hmg20bQ9Z104 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hmg20bQ9Z104 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hmg20bQ9Z104 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hmg20bQ9Z104 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hmg20bQ9Z104 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hmg20bQ9Z104 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Hmg20bQ9Z104 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hmg20bQ9Z104 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Hmg20bQ9Z104 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hmg20bQ9Z104 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hmg20bQ9Z104 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hmg20bQ9Z104 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hmg20bQ9Z104 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hmg20bQ9Z104 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Hmg20bQ9Z104 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hmg20bQ9Z104 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hmg20bQ9Z104 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hmg20bQ9Z104 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hmg20bQ9Z104 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hmg20bQ9Z104 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hmg20bQ9Z104 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hmg20bQ9Z104 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hmg20bQ9Z104 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hmg20bQ9Z104 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hmg20bQ9Z104 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Hmg20bQ9Z104 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hmg20bQ9Z104 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Hmg20bQ9Z104 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hmg20bQ9Z104 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hmg20bQ9Z104 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Hmg20bQ9Z104 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hmg20bQ9Z104 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hmg20bQ9Z104 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hmg20bQ9Z104 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hmg20bQ9Z104 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hmg20bQ9Z104 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hmg20bQ9Z104 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hmg20bQ9Z104 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hmg20bQ9Z104 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hmg20bQ9Z104 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hmg20bQ9Z104 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hmg20bQ9Z104 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hmg20bQ9Z104 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hmg20bQ9Z104 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hmg20bQ9Z104 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hmg20bQ9Z104 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hmg20bQ9Z104 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hmg20bQ9Z104 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hmg20bQ9Z104 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hmg20bQ9Z104 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hmg20bQ9Z104 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hmg20bQ9Z104 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hmg20bQ9Z104 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hmg20bQ9Z104 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hmg20bQ9Z104 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hmg20bQ9Z104 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hmg20bQ9Z104 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Hmg20bQ9Z104 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Hmg20bQ9Z104 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Hmg20bQ9Z104 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hmg20bQ9Z104 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hmg20bQ9Z104 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hmg20bQ9Z104 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Hmg20bQ9Z104 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hmg20bQ9Z104 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hmg20bQ9Z104 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hmg20bQ9Z104 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hmg20bQ9Z104 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hmg20bQ9Z104 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hmg20bQ9Z104 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hmg20bQ9Z104 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hmg20bQ9Z104 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hmg20bQ9Z104 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hmg20bQ9Z104 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hmg20bQ9Z104 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms