Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnip1Q9WUU8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnip1Q9WUU8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnip1Q9WUU8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnip1Q9WUU8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnip1Q9WUU8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnip1Q9WUU8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnip1Q9WUU8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnip1Q9WUU8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnip1Q9WUU8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnip1Q9WUU8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnip1Q9WUU8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnip1Q9WUU8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnip1Q9WUU8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnip1Q9WUU8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnip1Q9WUU8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnip1Q9WUU8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnip1Q9WUU8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnip1Q9WUU8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnip1Q9WUU8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnip1Q9WUU8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnip1Q9WUU8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnip1Q9WUU8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnip1Q9WUU8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnip1Q9WUU8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnip1Q9WUU8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnip1Q9WUU8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnip1Q9WUU8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnip1Q9WUU8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnip1Q9WUU8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnip1Q9WUU8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnip1Q9WUU8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnip1Q9WUU8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnip1Q9WUU8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnip1Q9WUU8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnip1Q9WUU8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnip1Q9WUU8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnip1Q9WUU8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnip1Q9WUU8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnip1Q9WUU8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnip1Q9WUU8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnip1Q9WUU8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tnip1Q9WUU8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tnip1Q9WUU8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnip1Q9WUU8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnip1Q9WUU8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Tnip1Q9WUU8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnip1Q9WUU8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnip1Q9WUU8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tnip1Q9WUU8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnip1Q9WUU8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnip1Q9WUU8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnip1Q9WUU8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnip1Q9WUU8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnip1Q9WUU8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnip1Q9WUU8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tnip1Q9WUU8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tnip1Q9WUU8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tnip1Q9WUU8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tnip1Q9WUU8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tnip1Q9WUU8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tnip1Q9WUU8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tnip1Q9WUU8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tnip1Q9WUU8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tnip1Q9WUU8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tnip1Q9WUU8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tnip1Q9WUU8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tnip1Q9WUU8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tnip1Q9WUU8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tnip1Q9WUU8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tnip1Q9WUU8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tnip1Q9WUU8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tnip1Q9WUU8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tnip1Q9WUU8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tnip1Q9WUU8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tnip1Q9WUU8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tnip1Q9WUU8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tnip1Q9WUU8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnip1Q9WUU8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnip1Q9WUU8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnip1Q9WUU8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnip1Q9WUU8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnip1Q9WUU8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnip1Q9WUU8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tnip1Q9WUU8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tnip1Q9WUU8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tnip1Q9WUU8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tnip1Q9WUU8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tnip1Q9WUU8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tnip1Q9WUU8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tnip1Q9WUU8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tnip1Q9WUU8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tnip1Q9WUU8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Tnip1Q9WUU8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnip1Q9WUU8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnip1Q9WUU8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnip1Q9WUU8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnip1Q9WUU8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnip1Q9WUU8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnip1Q9WUU8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms