Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB6

Clcnkb, Chloride channel protein ClC-Kb, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClcnkbQ9WUB6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ClcnkbQ9WUB6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ClcnkbQ9WUB6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ClcnkbQ9WUB6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ClcnkbQ9WUB6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ClcnkbQ9WUB6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ClcnkbQ9WUB6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ClcnkbQ9WUB6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ClcnkbQ9WUB6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ClcnkbQ9WUB6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClcnkbQ9WUB6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClcnkbQ9WUB6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClcnkbQ9WUB6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClcnkbQ9WUB6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClcnkbQ9WUB6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClcnkbQ9WUB6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ClcnkbQ9WUB6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ClcnkbQ9WUB6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ClcnkbQ9WUB6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ClcnkbQ9WUB6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClcnkbQ9WUB6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClcnkbQ9WUB6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClcnkbQ9WUB6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClcnkbQ9WUB6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClcnkbQ9WUB6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClcnkbQ9WUB6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClcnkbQ9WUB6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClcnkbQ9WUB6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClcnkbQ9WUB6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClcnkbQ9WUB6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClcnkbQ9WUB6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClcnkbQ9WUB6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClcnkbQ9WUB6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ClcnkbQ9WUB6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ClcnkbQ9WUB6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ClcnkbQ9WUB6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ClcnkbQ9WUB6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClcnkbQ9WUB6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClcnkbQ9WUB6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClcnkbQ9WUB6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClcnkbQ9WUB6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ClcnkbQ9WUB6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ClcnkbQ9WUB6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ClcnkbQ9WUB6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ClcnkbQ9WUB6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ClcnkbQ9WUB6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ClcnkbQ9WUB6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ClcnkbQ9WUB6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ClcnkbQ9WUB6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ClcnkbQ9WUB6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ClcnkbQ9WUB6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ClcnkbQ9WUB6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ClcnkbQ9WUB6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ClcnkbQ9WUB6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ClcnkbQ9WUB6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ClcnkbQ9WUB6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ClcnkbQ9WUB6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ClcnkbQ9WUB6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ClcnkbQ9WUB6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ClcnkbQ9WUB6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms