Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1W3

Rnf103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf103Q9R1W3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf103Q9R1W3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf103Q9R1W3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf103Q9R1W3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf103Q9R1W3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf103Q9R1W3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf103Q9R1W3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf103Q9R1W3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf103Q9R1W3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf103Q9R1W3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf103Q9R1W3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf103Q9R1W3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf103Q9R1W3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf103Q9R1W3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf103Q9R1W3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf103Q9R1W3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf103Q9R1W3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf103Q9R1W3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf103Q9R1W3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf103Q9R1W3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf103Q9R1W3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf103Q9R1W3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf103Q9R1W3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf103Q9R1W3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf103Q9R1W3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf103Q9R1W3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf103Q9R1W3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf103Q9R1W3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf103Q9R1W3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf103Q9R1W3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf103Q9R1W3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf103Q9R1W3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf103Q9R1W3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf103Q9R1W3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf103Q9R1W3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf103Q9R1W3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf103Q9R1W3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf103Q9R1W3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf103Q9R1W3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf103Q9R1W3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf103Q9R1W3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf103Q9R1W3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf103Q9R1W3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf103Q9R1W3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf103Q9R1W3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf103Q9R1W3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf103Q9R1W3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf103Q9R1W3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf103Q9R1W3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf103Q9R1W3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf103Q9R1W3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf103Q9R1W3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf103Q9R1W3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf103Q9R1W3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf103Q9R1W3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf103Q9R1W3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf103Q9R1W3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf103Q9R1W3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf103Q9R1W3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf103Q9R1W3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf103Q9R1W3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf103Q9R1W3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf103Q9R1W3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf103Q9R1W3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf103Q9R1W3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf103Q9R1W3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf103Q9R1W3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf103Q9R1W3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf103Q9R1W3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf103Q9R1W3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf103Q9R1W3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf103Q9R1W3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf103Q9R1W3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf103Q9R1W3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf103Q9R1W3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf103Q9R1W3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf103Q9R1W3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf103Q9R1W3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf103Q9R1W3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf103Q9R1W3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf103Q9R1W3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf103Q9R1W3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf103Q9R1W3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf103Q9R1W3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf103Q9R1W3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf103Q9R1W3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf103Q9R1W3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf103Q9R1W3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf103Q9R1W3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf103Q9R1W3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf103Q9R1W3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf103Q9R1W3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf103Q9R1W3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf103Q9R1W3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf103Q9R1W3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf103Q9R1W3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf103Q9R1W3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf103Q9R1W3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf103Q9R1W3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf103Q9R1W3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms