Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrpxQ9R0M3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrpxQ9R0M3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrpxQ9R0M3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrpxQ9R0M3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrpxQ9R0M3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrpxQ9R0M3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrpxQ9R0M3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrpxQ9R0M3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrpxQ9R0M3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrpxQ9R0M3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrpxQ9R0M3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SrpxQ9R0M3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrpxQ9R0M3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrpxQ9R0M3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrpxQ9R0M3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrpxQ9R0M3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrpxQ9R0M3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrpxQ9R0M3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrpxQ9R0M3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrpxQ9R0M3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrpxQ9R0M3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrpxQ9R0M3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrpxQ9R0M3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrpxQ9R0M3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrpxQ9R0M3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SrpxQ9R0M3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms