Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clca3a1Q9QX15 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clca3a1Q9QX15 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clca3a1Q9QX15 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clca3a1Q9QX15 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clca3a1Q9QX15 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clca3a1Q9QX15 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clca3a1Q9QX15 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clca3a1Q9QX15 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clca3a1Q9QX15 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clca3a1Q9QX15 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clca3a1Q9QX15 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Clca3a1Q9QX15 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Clca3a1Q9QX15 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Clca3a1Q9QX15 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clca3a1Q9QX15 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Clca3a1Q9QX15 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clca3a1Q9QX15 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clca3a1Q9QX15 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clca3a1Q9QX15 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clca3a1Q9QX15 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clca3a1Q9QX15 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clca3a1Q9QX15 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clca3a1Q9QX15 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clca3a1Q9QX15 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clca3a1Q9QX15 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clca3a1Q9QX15 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Clca3a1Q9QX15 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clca3a1Q9QX15 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clca3a1Q9QX15 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clca3a1Q9QX15 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clca3a1Q9QX15 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clca3a1Q9QX15 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clca3a1Q9QX15 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Clca3a1Q9QX15 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clca3a1Q9QX15 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clca3a1Q9QX15 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clca3a1Q9QX15 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clca3a1Q9QX15 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clca3a1Q9QX15 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clca3a1Q9QX15 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clca3a1Q9QX15 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clca3a1Q9QX15 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clca3a1Q9QX15 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clca3a1Q9QX15 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Clca3a1Q9QX15 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clca3a1Q9QX15 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clca3a1Q9QX15 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clca3a1Q9QX15 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clca3a1Q9QX15 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clca3a1Q9QX15 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clca3a1Q9QX15 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clca3a1Q9QX15 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clca3a1Q9QX15 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clca3a1Q9QX15 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clca3a1Q9QX15 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clca3a1Q9QX15 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clca3a1Q9QX15 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clca3a1Q9QX15 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clca3a1Q9QX15 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms