Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Mid2Q9QUS6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mid2Q9QUS6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mid2Q9QUS6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mid2Q9QUS6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mid2Q9QUS6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mid2Q9QUS6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mid2Q9QUS6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mid2Q9QUS6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mid2Q9QUS6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Mid2Q9QUS6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mid2Q9QUS6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mid2Q9QUS6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mid2Q9QUS6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mid2Q9QUS6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mid2Q9QUS6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mid2Q9QUS6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mid2Q9QUS6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Mid2Q9QUS6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mid2Q9QUS6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mid2Q9QUS6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mid2Q9QUS6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mid2Q9QUS6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mid2Q9QUS6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mid2Q9QUS6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mid2Q9QUS6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mid2Q9QUS6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mid2Q9QUS6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mid2Q9QUS6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mid2Q9QUS6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mid2Q9QUS6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mid2Q9QUS6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mid2Q9QUS6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mid2Q9QUS6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mid2Q9QUS6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mid2Q9QUS6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mid2Q9QUS6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mid2Q9QUS6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mid2Q9QUS6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mid2Q9QUS6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mid2Q9QUS6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mid2Q9QUS6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mid2Q9QUS6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Mid2Q9QUS6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mid2Q9QUS6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mid2Q9QUS6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mid2Q9QUS6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mid2Q9QUS6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mid2Q9QUS6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mid2Q9QUS6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Mid2Q9QUS6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mid2Q9QUS6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mid2Q9QUS6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mid2Q9QUS6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mid2Q9QUS6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mid2Q9QUS6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mid2Q9QUS6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mid2Q9QUS6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mid2Q9QUS6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mid2Q9QUS6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mid2Q9QUS6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mid2Q9QUS6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mid2Q9QUS6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mid2Q9QUS6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mid2Q9QUS6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mid2Q9QUS6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mid2Q9QUS6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mid2Q9QUS6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mid2Q9QUS6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mid2Q9QUS6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mid2Q9QUS6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mid2Q9QUS6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mid2Q9QUS6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mid2Q9QUS6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mid2Q9QUS6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mid2Q9QUS6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mid2Q9QUS6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mid2Q9QUS6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mid2Q9QUS6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mid2Q9QUS6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mid2Q9QUS6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mid2Q9QUS6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Mid2Q9QUS6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mid2Q9QUS6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mid2Q9QUS6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mid2Q9QUS6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mid2Q9QUS6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mid2Q9QUS6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mid2Q9QUS6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mid2Q9QUS6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mid2Q9QUS6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mid2Q9QUS6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mid2Q9QUS6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mid2Q9QUS6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mid2Q9QUS6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mid2Q9QUS6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mid2Q9QUS6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mid2Q9QUS6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mid2Q9QUS6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mid2Q9QUS6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms