Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF1

Gabrq, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit theta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabrqQ9JLF1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GabrqQ9JLF1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GabrqQ9JLF1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GabrqQ9JLF1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GabrqQ9JLF1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GabrqQ9JLF1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GabrqQ9JLF1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GabrqQ9JLF1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GabrqQ9JLF1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GabrqQ9JLF1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GabrqQ9JLF1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GabrqQ9JLF1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GabrqQ9JLF1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GabrqQ9JLF1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GabrqQ9JLF1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GabrqQ9JLF1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GabrqQ9JLF1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GabrqQ9JLF1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GabrqQ9JLF1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GabrqQ9JLF1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GabrqQ9JLF1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GabrqQ9JLF1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GabrqQ9JLF1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GabrqQ9JLF1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GabrqQ9JLF1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GabrqQ9JLF1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GabrqQ9JLF1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GabrqQ9JLF1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GabrqQ9JLF1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GabrqQ9JLF1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GabrqQ9JLF1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GabrqQ9JLF1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GabrqQ9JLF1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GabrqQ9JLF1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GabrqQ9JLF1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GabrqQ9JLF1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GabrqQ9JLF1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GabrqQ9JLF1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GabrqQ9JLF1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GabrqQ9JLF1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GabrqQ9JLF1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GabrqQ9JLF1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GabrqQ9JLF1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GabrqQ9JLF1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GabrqQ9JLF1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GabrqQ9JLF1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GabrqQ9JLF1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GabrqQ9JLF1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GabrqQ9JLF1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GabrqQ9JLF1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GabrqQ9JLF1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GabrqQ9JLF1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GabrqQ9JLF1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GabrqQ9JLF1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GabrqQ9JLF1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GabrqQ9JLF1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GabrqQ9JLF1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GabrqQ9JLF1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GabrqQ9JLF1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GabrqQ9JLF1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GabrqQ9JLF1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GabrqQ9JLF1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GabrqQ9JLF1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GabrqQ9JLF1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GabrqQ9JLF1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GabrqQ9JLF1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GabrqQ9JLF1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GabrqQ9JLF1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GabrqQ9JLF1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GabrqQ9JLF1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GabrqQ9JLF1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GabrqQ9JLF1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GabrqQ9JLF1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GabrqQ9JLF1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GabrqQ9JLF1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GabrqQ9JLF1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GabrqQ9JLF1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GabrqQ9JLF1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GabrqQ9JLF1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GabrqQ9JLF1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GabrqQ9JLF1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GabrqQ9JLF1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GabrqQ9JLF1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GabrqQ9JLF1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GabrqQ9JLF1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GabrqQ9JLF1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GabrqQ9JLF1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GabrqQ9JLF1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GabrqQ9JLF1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GabrqQ9JLF1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GabrqQ9JLF1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GabrqQ9JLF1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GabrqQ9JLF1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GabrqQ9JLF1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GabrqQ9JLF1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GabrqQ9JLF1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GabrqQ9JLF1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GabrqQ9JLF1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GabrqQ9JLF1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GabrqQ9JLF1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms