Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Arl6ip1Q9JKW0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arl6ip1Q9JKW0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arl6ip1Q9JKW0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arl6ip1Q9JKW0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arl6ip1Q9JKW0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arl6ip1Q9JKW0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arl6ip1Q9JKW0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl6ip1Q9JKW0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl6ip1Q9JKW0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl6ip1Q9JKW0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl6ip1Q9JKW0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl6ip1Q9JKW0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl6ip1Q9JKW0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl6ip1Q9JKW0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl6ip1Q9JKW0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl6ip1Q9JKW0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arl6ip1Q9JKW0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arl6ip1Q9JKW0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arl6ip1Q9JKW0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Arl6ip1Q9JKW0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arl6ip1Q9JKW0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arl6ip1Q9JKW0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arl6ip1Q9JKW0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arl6ip1Q9JKW0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arl6ip1Q9JKW0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arl6ip1Q9JKW0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arl6ip1Q9JKW0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arl6ip1Q9JKW0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arl6ip1Q9JKW0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arl6ip1Q9JKW0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arl6ip1Q9JKW0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arl6ip1Q9JKW0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arl6ip1Q9JKW0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arl6ip1Q9JKW0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arl6ip1Q9JKW0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arl6ip1Q9JKW0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arl6ip1Q9JKW0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arl6ip1Q9JKW0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arl6ip1Q9JKW0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arl6ip1Q9JKW0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arl6ip1Q9JKW0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arl6ip1Q9JKW0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arl6ip1Q9JKW0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arl6ip1Q9JKW0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arl6ip1Q9JKW0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arl6ip1Q9JKW0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Arl6ip1Q9JKW0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arl6ip1Q9JKW0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arl6ip1Q9JKW0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Arl6ip1Q9JKW0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arl6ip1Q9JKW0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arl6ip1Q9JKW0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arl6ip1Q9JKW0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Arl6ip1Q9JKW0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Arl6ip1Q9JKW0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Arl6ip1Q9JKW0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arl6ip1Q9JKW0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arl6ip1Q9JKW0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arl6ip1Q9JKW0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arl6ip1Q9JKW0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arl6ip1Q9JKW0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arl6ip1Q9JKW0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arl6ip1Q9JKW0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arl6ip1Q9JKW0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arl6ip1Q9JKW0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arl6ip1Q9JKW0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arl6ip1Q9JKW0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arl6ip1Q9JKW0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arl6ip1Q9JKW0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arl6ip1Q9JKW0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arl6ip1Q9JKW0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arl6ip1Q9JKW0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arl6ip1Q9JKW0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arl6ip1Q9JKW0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arl6ip1Q9JKW0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arl6ip1Q9JKW0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Arl6ip1Q9JKW0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arl6ip1Q9JKW0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arl6ip1Q9JKW0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arl6ip1Q9JKW0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arl6ip1Q9JKW0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arl6ip1Q9JKW0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arl6ip1Q9JKW0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arl6ip1Q9JKW0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arl6ip1Q9JKW0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arl6ip1Q9JKW0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Arl6ip1Q9JKW0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Arl6ip1Q9JKW0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Arl6ip1Q9JKW0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Arl6ip1Q9JKW0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Arl6ip1Q9JKW0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Arl6ip1Q9JKW0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Arl6ip1Q9JKW0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Arl6ip1Q9JKW0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Arl6ip1Q9JKW0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Arl6ip1Q9JKW0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Arl6ip1Q9JKW0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms