Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3glb1Q9JK48 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3glb1Q9JK48 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3glb1Q9JK48 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3glb1Q9JK48 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3glb1Q9JK48 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3glb1Q9JK48 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3glb1Q9JK48 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3glb1Q9JK48 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3glb1Q9JK48 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3glb1Q9JK48 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3glb1Q9JK48 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3glb1Q9JK48 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3glb1Q9JK48 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3glb1Q9JK48 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3glb1Q9JK48 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3glb1Q9JK48 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3glb1Q9JK48 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3glb1Q9JK48 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3glb1Q9JK48 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3glb1Q9JK48 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3glb1Q9JK48 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3glb1Q9JK48 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3glb1Q9JK48 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3glb1Q9JK48 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3glb1Q9JK48 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3glb1Q9JK48 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3glb1Q9JK48 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3glb1Q9JK48 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3glb1Q9JK48 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3glb1Q9JK48 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3glb1Q9JK48 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3glb1Q9JK48 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3glb1Q9JK48 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3glb1Q9JK48 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3glb1Q9JK48 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3glb1Q9JK48 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3glb1Q9JK48 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3glb1Q9JK48 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3glb1Q9JK48 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3glb1Q9JK48 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3glb1Q9JK48 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3glb1Q9JK48 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3glb1Q9JK48 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3glb1Q9JK48 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3glb1Q9JK48 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3glb1Q9JK48 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3glb1Q9JK48 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3glb1Q9JK48 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3glb1Q9JK48 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3glb1Q9JK48 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3glb1Q9JK48 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3glb1Q9JK48 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3glb1Q9JK48 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3glb1Q9JK48 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3glb1Q9JK48 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3glb1Q9JK48 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3glb1Q9JK48 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3glb1Q9JK48 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3glb1Q9JK48 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3glb1Q9JK48 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3glb1Q9JK48 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3glb1Q9JK48 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3glb1Q9JK48 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3glb1Q9JK48 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3glb1Q9JK48 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3glb1Q9JK48 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3glb1Q9JK48 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3glb1Q9JK48 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3glb1Q9JK48 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3glb1Q9JK48 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3glb1Q9JK48 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3glb1Q9JK48 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3glb1Q9JK48 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3glb1Q9JK48 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3glb1Q9JK48 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3glb1Q9JK48 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3glb1Q9JK48 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3glb1Q9JK48 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms