Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tuba8Q9JJZ2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tuba8Q9JJZ2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tuba8Q9JJZ2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tuba8Q9JJZ2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tuba8Q9JJZ2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tuba8Q9JJZ2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tuba8Q9JJZ2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tuba8Q9JJZ2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tuba8Q9JJZ2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tuba8Q9JJZ2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tuba8Q9JJZ2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tuba8Q9JJZ2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tuba8Q9JJZ2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tuba8Q9JJZ2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tuba8Q9JJZ2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tuba8Q9JJZ2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tuba8Q9JJZ2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tuba8Q9JJZ2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tuba8Q9JJZ2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tuba8Q9JJZ2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tuba8Q9JJZ2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tuba8Q9JJZ2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tuba8Q9JJZ2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tuba8Q9JJZ2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tuba8Q9JJZ2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tuba8Q9JJZ2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tuba8Q9JJZ2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tuba8Q9JJZ2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tuba8Q9JJZ2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tuba8Q9JJZ2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tuba8Q9JJZ2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tuba8Q9JJZ2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tuba8Q9JJZ2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tuba8Q9JJZ2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tuba8Q9JJZ2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tuba8Q9JJZ2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tuba8Q9JJZ2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tuba8Q9JJZ2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tuba8Q9JJZ2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tuba8Q9JJZ2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tuba8Q9JJZ2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tuba8Q9JJZ2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tuba8Q9JJZ2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tuba8Q9JJZ2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tuba8Q9JJZ2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tuba8Q9JJZ2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tuba8Q9JJZ2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tuba8Q9JJZ2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tuba8Q9JJZ2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tuba8Q9JJZ2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tuba8Q9JJZ2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tuba8Q9JJZ2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tuba8Q9JJZ2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tuba8Q9JJZ2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tuba8Q9JJZ2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tuba8Q9JJZ2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tuba8Q9JJZ2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tuba8Q9JJZ2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tuba8Q9JJZ2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tuba8Q9JJZ2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tuba8Q9JJZ2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tuba8Q9JJZ2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tuba8Q9JJZ2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.8 ms