Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Copb1Q9JIF7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Copb1Q9JIF7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Copb1Q9JIF7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Copb1Q9JIF7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Copb1Q9JIF7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Copb1Q9JIF7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Copb1Q9JIF7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Copb1Q9JIF7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Copb1Q9JIF7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Copb1Q9JIF7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Copb1Q9JIF7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Copb1Q9JIF7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Copb1Q9JIF7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Copb1Q9JIF7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Copb1Q9JIF7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Copb1Q9JIF7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Copb1Q9JIF7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Copb1Q9JIF7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Copb1Q9JIF7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Copb1Q9JIF7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Copb1Q9JIF7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Copb1Q9JIF7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Copb1Q9JIF7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Copb1Q9JIF7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Copb1Q9JIF7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Copb1Q9JIF7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Copb1Q9JIF7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Copb1Q9JIF7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Copb1Q9JIF7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Copb1Q9JIF7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Copb1Q9JIF7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Copb1Q9JIF7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Copb1Q9JIF7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Copb1Q9JIF7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Copb1Q9JIF7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Copb1Q9JIF7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Copb1Q9JIF7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Copb1Q9JIF7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Copb1Q9JIF7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Copb1Q9JIF7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Copb1Q9JIF7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Copb1Q9JIF7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Copb1Q9JIF7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Copb1Q9JIF7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Copb1Q9JIF7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Copb1Q9JIF7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Copb1Q9JIF7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Copb1Q9JIF7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Copb1Q9JIF7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Copb1Q9JIF7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Copb1Q9JIF7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Copb1Q9JIF7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Copb1Q9JIF7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Copb1Q9JIF7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Copb1Q9JIF7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Copb1Q9JIF7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Copb1Q9JIF7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Copb1Q9JIF7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Copb1Q9JIF7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Copb1Q9JIF7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Copb1Q9JIF7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Copb1Q9JIF7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Copb1Q9JIF7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Copb1Q9JIF7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Copb1Q9JIF7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Copb1Q9JIF7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Copb1Q9JIF7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Copb1Q9JIF7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Copb1Q9JIF7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Copb1Q9JIF7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Copb1Q9JIF7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Copb1Q9JIF7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Copb1Q9JIF7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Copb1Q9JIF7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Copb1Q9JIF7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Copb1Q9JIF7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Copb1Q9JIF7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Copb1Q9JIF7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Copb1Q9JIF7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Copb1Q9JIF7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Copb1Q9JIF7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Copb1Q9JIF7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Copb1Q9JIF7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Copb1Q9JIF7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Copb1Q9JIF7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Copb1Q9JIF7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Copb1Q9JIF7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Copb1Q9JIF7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Copb1Q9JIF7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Copb1Q9JIF7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Copb1Q9JIF7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Copb1Q9JIF7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Copb1Q9JIF7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Copb1Q9JIF7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Copb1Q9JIF7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Copb1Q9JIF7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Copb1Q9JIF7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Copb1Q9JIF7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Copb1Q9JIF7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms