Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA9

Ctsr, Cathepsin R, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsrQ9JIA9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtsrQ9JIA9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtsrQ9JIA9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtsrQ9JIA9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CtsrQ9JIA9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CtsrQ9JIA9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CtsrQ9JIA9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CtsrQ9JIA9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CtsrQ9JIA9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CtsrQ9JIA9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsrQ9JIA9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsrQ9JIA9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsrQ9JIA9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsrQ9JIA9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsrQ9JIA9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsrQ9JIA9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsrQ9JIA9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtsrQ9JIA9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtsrQ9JIA9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CtsrQ9JIA9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtsrQ9JIA9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtsrQ9JIA9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CtsrQ9JIA9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CtsrQ9JIA9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtsrQ9JIA9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtsrQ9JIA9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtsrQ9JIA9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtsrQ9JIA9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtsrQ9JIA9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtsrQ9JIA9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtsrQ9JIA9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CtsrQ9JIA9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtsrQ9JIA9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtsrQ9JIA9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtsrQ9JIA9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtsrQ9JIA9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtsrQ9JIA9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtsrQ9JIA9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtsrQ9JIA9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtsrQ9JIA9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtsrQ9JIA9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtsrQ9JIA9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtsrQ9JIA9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtsrQ9JIA9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtsrQ9JIA9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtsrQ9JIA9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CtsrQ9JIA9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CtsrQ9JIA9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtsrQ9JIA9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtsrQ9JIA9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtsrQ9JIA9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CtsrQ9JIA9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtsrQ9JIA9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtsrQ9JIA9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtsrQ9JIA9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtsrQ9JIA9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtsrQ9JIA9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtsrQ9JIA9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtsrQ9JIA9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtsrQ9JIA9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtsrQ9JIA9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtsrQ9JIA9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtsrQ9JIA9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsrQ9JIA9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsrQ9JIA9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsrQ9JIA9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsrQ9JIA9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsrQ9JIA9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsrQ9JIA9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtsrQ9JIA9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtsrQ9JIA9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtsrQ9JIA9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtsrQ9JIA9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtsrQ9JIA9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtsrQ9JIA9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtsrQ9JIA9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtsrQ9JIA9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtsrQ9JIA9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsrQ9JIA9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsrQ9JIA9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsrQ9JIA9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsrQ9JIA9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsrQ9JIA9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsrQ9JIA9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CtsrQ9JIA9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CtsrQ9JIA9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CtsrQ9JIA9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CtsrQ9JIA9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CtsrQ9JIA9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtsrQ9JIA9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtsrQ9JIA9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtsrQ9JIA9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtsrQ9JIA9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtsrQ9JIA9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtsrQ9JIA9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtsrQ9JIA9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtsrQ9JIA9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtsrQ9JIA9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CtsrQ9JIA9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CtsrQ9JIA9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms