Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI91

Actn2, Alpha-actinin-2, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn2Q9JI91 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Actn2Q9JI91 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Actn2Q9JI91 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Actn2Q9JI91 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Actn2Q9JI91 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Actn2Q9JI91 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Actn2Q9JI91 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Actn2Q9JI91 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Actn2Q9JI91 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Actn2Q9JI91 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Actn2Q9JI91 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Actn2Q9JI91 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Actn2Q9JI91 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Actn2Q9JI91 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Actn2Q9JI91 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Actn2Q9JI91 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Actn2Q9JI91 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Actn2Q9JI91 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Actn2Q9JI91 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Actn2Q9JI91 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Actn2Q9JI91 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Actn2Q9JI91 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Actn2Q9JI91 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Actn2Q9JI91 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Actn2Q9JI91 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Actn2Q9JI91 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Actn2Q9JI91 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Actn2Q9JI91 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Actn2Q9JI91 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Actn2Q9JI91 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Actn2Q9JI91 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Actn2Q9JI91 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Actn2Q9JI91 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Actn2Q9JI91 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Actn2Q9JI91 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Actn2Q9JI91 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Actn2Q9JI91 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Actn2Q9JI91 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Actn2Q9JI91 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Actn2Q9JI91 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Actn2Q9JI91 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Actn2Q9JI91 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Actn2Q9JI91 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Actn2Q9JI91 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Actn2Q9JI91 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Actn2Q9JI91 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Actn2Q9JI91 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Actn2Q9JI91 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Actn2Q9JI91 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Actn2Q9JI91 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Actn2Q9JI91 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Actn2Q9JI91 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Actn2Q9JI91 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Actn2Q9JI91 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Actn2Q9JI91 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Actn2Q9JI91 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Actn2Q9JI91 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Actn2Q9JI91 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Actn2Q9JI91 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Actn2Q9JI91 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Actn2Q9JI91 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Actn2Q9JI91 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Actn2Q9JI91 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Actn2Q9JI91 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Actn2Q9JI91 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Actn2Q9JI91 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Actn2Q9JI91 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Actn2Q9JI91 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Actn2Q9JI91 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Actn2Q9JI91 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Actn2Q9JI91 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Actn2Q9JI91 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Actn2Q9JI91 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Actn2Q9JI91 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Actn2Q9JI91 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Actn2Q9JI91 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Actn2Q9JI91 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Actn2Q9JI91 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Actn2Q9JI91 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Actn2Q9JI91 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Actn2Q9JI91 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Actn2Q9JI91 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Actn2Q9JI91 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Actn2Q9JI91 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Actn2Q9JI91 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Actn2Q9JI91 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Actn2Q9JI91 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Actn2Q9JI91 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Actn2Q9JI91 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Actn2Q9JI91 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Actn2Q9JI91 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Actn2Q9JI91 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Actn2Q9JI91 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Actn2Q9JI91 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Actn2Q9JI91 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Actn2Q9JI91 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Actn2Q9JI91 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Actn2Q9JI91 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Actn2Q9JI91 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Actn2Q9JI91 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms