Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcirg1Q9JHF5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcirg1Q9JHF5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcirg1Q9JHF5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tcirg1Q9JHF5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcirg1Q9JHF5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcirg1Q9JHF5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcirg1Q9JHF5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcirg1Q9JHF5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcirg1Q9JHF5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcirg1Q9JHF5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcirg1Q9JHF5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcirg1Q9JHF5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcirg1Q9JHF5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcirg1Q9JHF5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcirg1Q9JHF5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcirg1Q9JHF5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcirg1Q9JHF5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcirg1Q9JHF5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcirg1Q9JHF5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcirg1Q9JHF5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcirg1Q9JHF5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcirg1Q9JHF5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcirg1Q9JHF5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tcirg1Q9JHF5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tcirg1Q9JHF5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tcirg1Q9JHF5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcirg1Q9JHF5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcirg1Q9JHF5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcirg1Q9JHF5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcirg1Q9JHF5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcirg1Q9JHF5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcirg1Q9JHF5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tcirg1Q9JHF5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tcirg1Q9JHF5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tcirg1Q9JHF5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tcirg1Q9JHF5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tcirg1Q9JHF5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tcirg1Q9JHF5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tcirg1Q9JHF5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcirg1Q9JHF5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcirg1Q9JHF5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcirg1Q9JHF5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcirg1Q9JHF5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcirg1Q9JHF5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcirg1Q9JHF5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcirg1Q9JHF5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcirg1Q9JHF5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcirg1Q9JHF5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcirg1Q9JHF5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcirg1Q9JHF5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcirg1Q9JHF5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcirg1Q9JHF5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tcirg1Q9JHF5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcirg1Q9JHF5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcirg1Q9JHF5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcirg1Q9JHF5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcirg1Q9JHF5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcirg1Q9JHF5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcirg1Q9JHF5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcirg1Q9JHF5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcirg1Q9JHF5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcirg1Q9JHF5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcirg1Q9JHF5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcirg1Q9JHF5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcirg1Q9JHF5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcirg1Q9JHF5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcirg1Q9JHF5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcirg1Q9JHF5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcirg1Q9JHF5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcirg1Q9JHF5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcirg1Q9JHF5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcirg1Q9JHF5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcirg1Q9JHF5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcirg1Q9JHF5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcirg1Q9JHF5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcirg1Q9JHF5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcirg1Q9JHF5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcirg1Q9JHF5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcirg1Q9JHF5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcirg1Q9JHF5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcirg1Q9JHF5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcirg1Q9JHF5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcirg1Q9JHF5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tcirg1Q9JHF5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcirg1Q9JHF5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcirg1Q9JHF5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcirg1Q9JHF5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcirg1Q9JHF5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcirg1Q9JHF5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcirg1Q9JHF5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcirg1Q9JHF5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcirg1Q9JHF5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcirg1Q9JHF5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcirg1Q9JHF5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcirg1Q9JHF5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcirg1Q9JHF5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcirg1Q9JHF5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms