Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox9Q9EQM5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox9Q9EQM5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox9Q9EQM5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhox9Q9EQM5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhox9Q9EQM5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhox9Q9EQM5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhox9Q9EQM5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhox9Q9EQM5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox9Q9EQM5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Rhox9Q9EQM5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox9Q9EQM5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox9Q9EQM5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox9Q9EQM5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox9Q9EQM5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox9Q9EQM5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox9Q9EQM5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox9Q9EQM5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox9Q9EQM5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox9Q9EQM5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox9Q9EQM5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox9Q9EQM5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox9Q9EQM5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox9Q9EQM5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox9Q9EQM5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox9Q9EQM5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox9Q9EQM5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox9Q9EQM5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox9Q9EQM5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox9Q9EQM5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox9Q9EQM5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox9Q9EQM5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox9Q9EQM5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox9Q9EQM5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox9Q9EQM5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox9Q9EQM5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox9Q9EQM5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox9Q9EQM5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox9Q9EQM5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox9Q9EQM5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox9Q9EQM5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox9Q9EQM5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox9Q9EQM5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox9Q9EQM5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox9Q9EQM5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox9Q9EQM5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox9Q9EQM5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox9Q9EQM5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox9Q9EQM5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox9Q9EQM5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox9Q9EQM5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox9Q9EQM5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox9Q9EQM5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox9Q9EQM5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox9Q9EQM5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox9Q9EQM5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox9Q9EQM5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox9Q9EQM5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox9Q9EQM5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox9Q9EQM5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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