Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ap3s1Q9DCR2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ap3s1Q9DCR2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ap3s1Q9DCR2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ap3s1Q9DCR2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ap3s1Q9DCR2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ap3s1Q9DCR2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ap3s1Q9DCR2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ap3s1Q9DCR2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ap3s1Q9DCR2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ap3s1Q9DCR2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ap3s1Q9DCR2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ap3s1Q9DCR2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ap3s1Q9DCR2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ap3s1Q9DCR2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ap3s1Q9DCR2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ap3s1Q9DCR2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ap3s1Q9DCR2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ap3s1Q9DCR2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ap3s1Q9DCR2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ap3s1Q9DCR2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ap3s1Q9DCR2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ap3s1Q9DCR2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ap3s1Q9DCR2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ap3s1Q9DCR2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ap3s1Q9DCR2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ap3s1Q9DCR2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms