Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cbx6Q9DBY5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cbx6Q9DBY5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cbx6Q9DBY5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cbx6Q9DBY5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cbx6Q9DBY5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cbx6Q9DBY5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cbx6Q9DBY5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cbx6Q9DBY5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cbx6Q9DBY5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cbx6Q9DBY5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cbx6Q9DBY5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cbx6Q9DBY5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cbx6Q9DBY5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cbx6Q9DBY5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cbx6Q9DBY5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cbx6Q9DBY5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cbx6Q9DBY5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cbx6Q9DBY5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cbx6Q9DBY5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Cbx6Q9DBY5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cbx6Q9DBY5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Cbx6Q9DBY5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cbx6Q9DBY5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cbx6Q9DBY5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cbx6Q9DBY5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cbx6Q9DBY5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cbx6Q9DBY5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cbx6Q9DBY5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cbx6Q9DBY5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cbx6Q9DBY5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cbx6Q9DBY5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cbx6Q9DBY5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cbx6Q9DBY5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cbx6Q9DBY5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cbx6Q9DBY5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cbx6Q9DBY5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cbx6Q9DBY5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cbx6Q9DBY5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cbx6Q9DBY5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cbx6Q9DBY5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cbx6Q9DBY5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cbx6Q9DBY5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cbx6Q9DBY5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cbx6Q9DBY5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cbx6Q9DBY5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cbx6Q9DBY5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cbx6Q9DBY5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cbx6Q9DBY5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cbx6Q9DBY5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cbx6Q9DBY5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cbx6Q9DBY5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cbx6Q9DBY5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cbx6Q9DBY5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Cbx6Q9DBY5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cbx6Q9DBY5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cbx6Q9DBY5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cbx6Q9DBY5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cbx6Q9DBY5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cbx6Q9DBY5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cbx6Q9DBY5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cbx6Q9DBY5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cbx6Q9DBY5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cbx6Q9DBY5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cbx6Q9DBY5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cbx6Q9DBY5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cbx6Q9DBY5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cbx6Q9DBY5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cbx6Q9DBY5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cbx6Q9DBY5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cbx6Q9DBY5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cbx6Q9DBY5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cbx6Q9DBY5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cbx6Q9DBY5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cbx6Q9DBY5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cbx6Q9DBY5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cbx6Q9DBY5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cbx6Q9DBY5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cbx6Q9DBY5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cbx6Q9DBY5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cbx6Q9DBY5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cbx6Q9DBY5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cbx6Q9DBY5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cbx6Q9DBY5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cbx6Q9DBY5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cbx6Q9DBY5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cbx6Q9DBY5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cbx6Q9DBY5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cbx6Q9DBY5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cbx6Q9DBY5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cbx6Q9DBY5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cbx6Q9DBY5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cbx6Q9DBY5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cbx6Q9DBY5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cbx6Q9DBY5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cbx6Q9DBY5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cbx6Q9DBY5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cbx6Q9DBY5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cbx6Q9DBY5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cbx6Q9DBY5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms