Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Riok3Q9DBU3 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Riok3Q9DBU3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Riok3Q9DBU3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Riok3Q9DBU3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Riok3Q9DBU3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Riok3Q9DBU3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Riok3Q9DBU3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Riok3Q9DBU3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Riok3Q9DBU3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Riok3Q9DBU3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Riok3Q9DBU3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Riok3Q9DBU3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Riok3Q9DBU3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Riok3Q9DBU3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Riok3Q9DBU3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Riok3Q9DBU3 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Riok3Q9DBU3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Riok3Q9DBU3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Riok3Q9DBU3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Riok3Q9DBU3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Riok3Q9DBU3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Riok3Q9DBU3 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Riok3Q9DBU3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Riok3Q9DBU3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Riok3Q9DBU3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Riok3Q9DBU3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Riok3Q9DBU3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Riok3Q9DBU3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Riok3Q9DBU3 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Riok3Q9DBU3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Riok3Q9DBU3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Riok3Q9DBU3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Riok3Q9DBU3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Riok3Q9DBU3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Riok3Q9DBU3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Riok3Q9DBU3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Riok3Q9DBU3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Riok3Q9DBU3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Riok3Q9DBU3 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Riok3Q9DBU3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Riok3Q9DBU3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Riok3Q9DBU3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Riok3Q9DBU3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Riok3Q9DBU3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Riok3Q9DBU3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Riok3Q9DBU3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Riok3Q9DBU3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Riok3Q9DBU3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Riok3Q9DBU3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Riok3Q9DBU3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Riok3Q9DBU3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Riok3Q9DBU3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Riok3Q9DBU3 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Riok3Q9DBU3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Riok3Q9DBU3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Riok3Q9DBU3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Riok3Q9DBU3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Riok3Q9DBU3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Riok3Q9DBU3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Riok3Q9DBU3 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Riok3Q9DBU3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Riok3Q9DBU3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Riok3Q9DBU3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Riok3Q9DBU3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms