Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Xrn2Q9DBR1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Xrn2Q9DBR1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Xrn2Q9DBR1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Xrn2Q9DBR1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Xrn2Q9DBR1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Xrn2Q9DBR1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Xrn2Q9DBR1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Xrn2Q9DBR1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Xrn2Q9DBR1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Xrn2Q9DBR1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Xrn2Q9DBR1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Xrn2Q9DBR1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Xrn2Q9DBR1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Xrn2Q9DBR1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Xrn2Q9DBR1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Xrn2Q9DBR1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Xrn2Q9DBR1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Xrn2Q9DBR1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Xrn2Q9DBR1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Xrn2Q9DBR1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Xrn2Q9DBR1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Xrn2Q9DBR1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Xrn2Q9DBR1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Xrn2Q9DBR1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Xrn2Q9DBR1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Xrn2Q9DBR1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Xrn2Q9DBR1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Xrn2Q9DBR1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Xrn2Q9DBR1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Xrn2Q9DBR1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Xrn2Q9DBR1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Xrn2Q9DBR1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Xrn2Q9DBR1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Xrn2Q9DBR1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Xrn2Q9DBR1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Xrn2Q9DBR1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Xrn2Q9DBR1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Xrn2Q9DBR1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Xrn2Q9DBR1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Xrn2Q9DBR1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Xrn2Q9DBR1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Xrn2Q9DBR1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Xrn2Q9DBR1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Xrn2Q9DBR1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Xrn2Q9DBR1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Xrn2Q9DBR1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Xrn2Q9DBR1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Xrn2Q9DBR1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Xrn2Q9DBR1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Xrn2Q9DBR1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Xrn2Q9DBR1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Xrn2Q9DBR1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Xrn2Q9DBR1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Xrn2Q9DBR1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Xrn2Q9DBR1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Xrn2Q9DBR1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Xrn2Q9DBR1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Xrn2Q9DBR1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Xrn2Q9DBR1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Xrn2Q9DBR1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Xrn2Q9DBR1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Xrn2Q9DBR1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Xrn2Q9DBR1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Xrn2Q9DBR1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Xrn2Q9DBR1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Xrn2Q9DBR1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Xrn2Q9DBR1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Xrn2Q9DBR1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Xrn2Q9DBR1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Xrn2Q9DBR1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Xrn2Q9DBR1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Xrn2Q9DBR1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Xrn2Q9DBR1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Xrn2Q9DBR1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Xrn2Q9DBR1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Xrn2Q9DBR1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Xrn2Q9DBR1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Xrn2Q9DBR1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Xrn2Q9DBR1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Xrn2Q9DBR1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Xrn2Q9DBR1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Xrn2Q9DBR1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Xrn2Q9DBR1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Xrn2Q9DBR1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Xrn2Q9DBR1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Xrn2Q9DBR1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Xrn2Q9DBR1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Xrn2Q9DBR1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Xrn2Q9DBR1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Xrn2Q9DBR1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Xrn2Q9DBR1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Xrn2Q9DBR1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Xrn2Q9DBR1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Xrn2Q9DBR1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Xrn2Q9DBR1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Xrn2Q9DBR1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Xrn2Q9DBR1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Xrn2Q9DBR1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Xrn2Q9DBR1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms