Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fundc1Q9DB70 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fundc1Q9DB70 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fundc1Q9DB70 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Fundc1Q9DB70 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fundc1Q9DB70 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fundc1Q9DB70 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fundc1Q9DB70 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fundc1Q9DB70 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fundc1Q9DB70 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fundc1Q9DB70 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fundc1Q9DB70 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fundc1Q9DB70 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fundc1Q9DB70 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fundc1Q9DB70 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fundc1Q9DB70 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fundc1Q9DB70 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fundc1Q9DB70 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fundc1Q9DB70 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fundc1Q9DB70 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fundc1Q9DB70 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fundc1Q9DB70 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fundc1Q9DB70 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fundc1Q9DB70 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fundc1Q9DB70 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fundc1Q9DB70 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fundc1Q9DB70 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fundc1Q9DB70 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fundc1Q9DB70 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fundc1Q9DB70 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Fundc1Q9DB70 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fundc1Q9DB70 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fundc1Q9DB70 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fundc1Q9DB70 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fundc1Q9DB70 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fundc1Q9DB70 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fundc1Q9DB70 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fundc1Q9DB70 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fundc1Q9DB70 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fundc1Q9DB70 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fundc1Q9DB70 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fundc1Q9DB70 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fundc1Q9DB70 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fundc1Q9DB70 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fundc1Q9DB70 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fundc1Q9DB70 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fundc1Q9DB70 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fundc1Q9DB70 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fundc1Q9DB70 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fundc1Q9DB70 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fundc1Q9DB70 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fundc1Q9DB70 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fundc1Q9DB70 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fundc1Q9DB70 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fundc1Q9DB70 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fundc1Q9DB70 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fundc1Q9DB70 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fundc1Q9DB70 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fundc1Q9DB70 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fundc1Q9DB70 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fundc1Q9DB70 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fundc1Q9DB70 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fundc1Q9DB70 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fundc1Q9DB70 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fundc1Q9DB70 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fundc1Q9DB70 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fundc1Q9DB70 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fundc1Q9DB70 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fundc1Q9DB70 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fundc1Q9DB70 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fundc1Q9DB70 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fundc1Q9DB70 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fundc1Q9DB70 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fundc1Q9DB70 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fundc1Q9DB70 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fundc1Q9DB70 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fundc1Q9DB70 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fundc1Q9DB70 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fundc1Q9DB70 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fundc1Q9DB70 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fundc1Q9DB70 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fundc1Q9DB70 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fundc1Q9DB70 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fundc1Q9DB70 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fundc1Q9DB70 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fundc1Q9DB70 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fundc1Q9DB70 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fundc1Q9DB70 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fundc1Q9DB70 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fundc1Q9DB70 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fundc1Q9DB70 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fundc1Q9DB70 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fundc1Q9DB70 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fundc1Q9DB70 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fundc1Q9DB70 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fundc1Q9DB70 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fundc1Q9DB70 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fundc1Q9DB70 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Fundc1Q9DB70 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fundc1Q9DB70 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms