Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB10

Smdt1, Essential MCU regulator, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smdt1Q9DB10 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smdt1Q9DB10 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smdt1Q9DB10 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smdt1Q9DB10 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smdt1Q9DB10 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smdt1Q9DB10 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smdt1Q9DB10 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smdt1Q9DB10 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smdt1Q9DB10 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smdt1Q9DB10 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smdt1Q9DB10 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smdt1Q9DB10 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smdt1Q9DB10 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smdt1Q9DB10 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smdt1Q9DB10 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smdt1Q9DB10 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smdt1Q9DB10 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smdt1Q9DB10 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smdt1Q9DB10 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Smdt1Q9DB10 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smdt1Q9DB10 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smdt1Q9DB10 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smdt1Q9DB10 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smdt1Q9DB10 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smdt1Q9DB10 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smdt1Q9DB10 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smdt1Q9DB10 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smdt1Q9DB10 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smdt1Q9DB10 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms