Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA83

1700018B08Rik, RIKEN cDNA 1700018B08, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018B08RikQ9DA83 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
1700018B08RikQ9DA83 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
1700018B08RikQ9DA83 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
1700018B08RikQ9DA83 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
1700018B08RikQ9DA83 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
1700018B08RikQ9DA83 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
1700018B08RikQ9DA83 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
1700018B08RikQ9DA83 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
1700018B08RikQ9DA83 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
1700018B08RikQ9DA83 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
1700018B08RikQ9DA83 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
1700018B08RikQ9DA83 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
1700018B08RikQ9DA83 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
1700018B08RikQ9DA83 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
1700018B08RikQ9DA83 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
1700018B08RikQ9DA83 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
1700018B08RikQ9DA83 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
1700018B08RikQ9DA83 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
1700018B08RikQ9DA83 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
1700018B08RikQ9DA83 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
1700018B08RikQ9DA83 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
1700018B08RikQ9DA83 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
1700018B08RikQ9DA83 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
1700018B08RikQ9DA83 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
1700018B08RikQ9DA83 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
1700018B08RikQ9DA83 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
1700018B08RikQ9DA83 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
1700018B08RikQ9DA83 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
1700018B08RikQ9DA83 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
1700018B08RikQ9DA83 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
1700018B08RikQ9DA83 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
1700018B08RikQ9DA83 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
1700018B08RikQ9DA83 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
1700018B08RikQ9DA83 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
1700018B08RikQ9DA83 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
1700018B08RikQ9DA83 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
1700018B08RikQ9DA83 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
1700018B08RikQ9DA83 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
1700018B08RikQ9DA83 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
1700018B08RikQ9DA83 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
1700018B08RikQ9DA83 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
1700018B08RikQ9DA83 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
1700018B08RikQ9DA83 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
1700018B08RikQ9DA83 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
1700018B08RikQ9DA83 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
1700018B08RikQ9DA83 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
1700018B08RikQ9DA83 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
1700018B08RikQ9DA83 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
1700018B08RikQ9DA83 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
1700018B08RikQ9DA83 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
1700018B08RikQ9DA83 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
1700018B08RikQ9DA83 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
1700018B08RikQ9DA83 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
1700018B08RikQ9DA83 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
1700018B08RikQ9DA83 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
1700018B08RikQ9DA83 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
1700018B08RikQ9DA83 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
1700018B08RikQ9DA83 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
1700018B08RikQ9DA83 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
1700018B08RikQ9DA83 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
1700018B08RikQ9DA83 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
1700018B08RikQ9DA83 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
1700018B08RikQ9DA83 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
1700018B08RikQ9DA83 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
1700018B08RikQ9DA83 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
1700018B08RikQ9DA83 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
1700018B08RikQ9DA83 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
1700018B08RikQ9DA83 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
1700018B08RikQ9DA83 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
1700018B08RikQ9DA83 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
1700018B08RikQ9DA83 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
1700018B08RikQ9DA83 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
1700018B08RikQ9DA83 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
1700018B08RikQ9DA83 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
1700018B08RikQ9DA83 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
1700018B08RikQ9DA83 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
1700018B08RikQ9DA83 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
1700018B08RikQ9DA83 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
1700018B08RikQ9DA83 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
1700018B08RikQ9DA83 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
1700018B08RikQ9DA83 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
1700018B08RikQ9DA83 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
1700018B08RikQ9DA83 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
1700018B08RikQ9DA83 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
1700018B08RikQ9DA83 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
1700018B08RikQ9DA83 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
1700018B08RikQ9DA83 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
1700018B08RikQ9DA83 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
1700018B08RikQ9DA83 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
1700018B08RikQ9DA83 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
1700018B08RikQ9DA83 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
1700018B08RikQ9DA83 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
1700018B08RikQ9DA83 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
1700018B08RikQ9DA83 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
1700018B08RikQ9DA83 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
1700018B08RikQ9DA83 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
1700018B08RikQ9DA83 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
1700018B08RikQ9DA83 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
1700018B08RikQ9DA83 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
1700018B08RikQ9DA83 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms