Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N8

Pradc1, Protease-associated domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pradc1Q9D9N8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pradc1Q9D9N8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pradc1Q9D9N8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pradc1Q9D9N8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms