Protein–RNA interactions for Protein: Q9D864

Actr6, Actin-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr6Q9D864 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actr6Q9D864 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actr6Q9D864 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actr6Q9D864 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actr6Q9D864 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actr6Q9D864 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actr6Q9D864 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actr6Q9D864 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Actr6Q9D864 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Actr6Q9D864 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Actr6Q9D864 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Actr6Q9D864 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Actr6Q9D864 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Actr6Q9D864 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Actr6Q9D864 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Actr6Q9D864 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Actr6Q9D864 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Actr6Q9D864 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Actr6Q9D864 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Actr6Q9D864 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Actr6Q9D864 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Actr6Q9D864 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Actr6Q9D864 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Actr6Q9D864 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Actr6Q9D864 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Actr6Q9D864 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Actr6Q9D864 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Actr6Q9D864 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Actr6Q9D864 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Actr6Q9D864 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Actr6Q9D864 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Actr6Q9D864 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Actr6Q9D864 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Actr6Q9D864 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Actr6Q9D864 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Actr6Q9D864 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Actr6Q9D864 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Actr6Q9D864 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Actr6Q9D864 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Actr6Q9D864 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Actr6Q9D864 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Actr6Q9D864 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Actr6Q9D864 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Actr6Q9D864 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Actr6Q9D864 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Actr6Q9D864 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Actr6Q9D864 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Actr6Q9D864 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Actr6Q9D864 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Actr6Q9D864 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Actr6Q9D864 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Actr6Q9D864 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Actr6Q9D864 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Actr6Q9D864 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Actr6Q9D864 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Actr6Q9D864 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Actr6Q9D864 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Actr6Q9D864 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Actr6Q9D864 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms