Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tspan17Q9D7W4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tspan17Q9D7W4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tspan17Q9D7W4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tspan17Q9D7W4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tspan17Q9D7W4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tspan17Q9D7W4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tspan17Q9D7W4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tspan17Q9D7W4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tspan17Q9D7W4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tspan17Q9D7W4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tspan17Q9D7W4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tspan17Q9D7W4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tspan17Q9D7W4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tspan17Q9D7W4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tspan17Q9D7W4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tspan17Q9D7W4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tspan17Q9D7W4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tspan17Q9D7W4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tspan17Q9D7W4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tspan17Q9D7W4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tspan17Q9D7W4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tspan17Q9D7W4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tspan17Q9D7W4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tspan17Q9D7W4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tspan17Q9D7W4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tspan17Q9D7W4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tspan17Q9D7W4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tspan17Q9D7W4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tspan17Q9D7W4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tspan17Q9D7W4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tspan17Q9D7W4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tspan17Q9D7W4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tspan17Q9D7W4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tspan17Q9D7W4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tspan17Q9D7W4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tspan17Q9D7W4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tspan17Q9D7W4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tspan17Q9D7W4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tspan17Q9D7W4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tspan17Q9D7W4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tspan17Q9D7W4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tspan17Q9D7W4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tspan17Q9D7W4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tspan17Q9D7W4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tspan17Q9D7W4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tspan17Q9D7W4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tspan17Q9D7W4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tspan17Q9D7W4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tspan17Q9D7W4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tspan17Q9D7W4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tspan17Q9D7W4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tspan17Q9D7W4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tspan17Q9D7W4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tspan17Q9D7W4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan17Q9D7W4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan17Q9D7W4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan17Q9D7W4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan17Q9D7W4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan17Q9D7W4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan17Q9D7W4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan17Q9D7W4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan17Q9D7W4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan17Q9D7W4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tspan17Q9D7W4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tspan17Q9D7W4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tspan17Q9D7W4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tspan17Q9D7W4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tspan17Q9D7W4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tspan17Q9D7W4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tspan17Q9D7W4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tspan17Q9D7W4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tspan17Q9D7W4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tspan17Q9D7W4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tspan17Q9D7W4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tspan17Q9D7W4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tspan17Q9D7W4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tspan17Q9D7W4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tspan17Q9D7W4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tspan17Q9D7W4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tspan17Q9D7W4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tspan17Q9D7W4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tspan17Q9D7W4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tspan17Q9D7W4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tspan17Q9D7W4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tspan17Q9D7W4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tspan17Q9D7W4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tspan17Q9D7W4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tspan17Q9D7W4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tspan17Q9D7W4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tspan17Q9D7W4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tspan17Q9D7W4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tspan17Q9D7W4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tspan17Q9D7W4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tspan17Q9D7W4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tspan17Q9D7W4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tspan17Q9D7W4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tspan17Q9D7W4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tspan17Q9D7W4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tspan17Q9D7W4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms