Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
4930449I24RikQ9D5E3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930449I24RikQ9D5E3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930449I24RikQ9D5E3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930449I24RikQ9D5E3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930449I24RikQ9D5E3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930449I24RikQ9D5E3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930449I24RikQ9D5E3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930449I24RikQ9D5E3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930449I24RikQ9D5E3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930449I24RikQ9D5E3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930449I24RikQ9D5E3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930449I24RikQ9D5E3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
4930449I24RikQ9D5E3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930449I24RikQ9D5E3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930449I24RikQ9D5E3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930449I24RikQ9D5E3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930449I24RikQ9D5E3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930449I24RikQ9D5E3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930449I24RikQ9D5E3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930449I24RikQ9D5E3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
4930449I24RikQ9D5E3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930449I24RikQ9D5E3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930449I24RikQ9D5E3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930449I24RikQ9D5E3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930449I24RikQ9D5E3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930449I24RikQ9D5E3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930449I24RikQ9D5E3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930449I24RikQ9D5E3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930449I24RikQ9D5E3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930449I24RikQ9D5E3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930449I24RikQ9D5E3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930449I24RikQ9D5E3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930449I24RikQ9D5E3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930449I24RikQ9D5E3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930449I24RikQ9D5E3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930449I24RikQ9D5E3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930449I24RikQ9D5E3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930449I24RikQ9D5E3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930449I24RikQ9D5E3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930449I24RikQ9D5E3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930449I24RikQ9D5E3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930449I24RikQ9D5E3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930449I24RikQ9D5E3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930449I24RikQ9D5E3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930449I24RikQ9D5E3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930449I24RikQ9D5E3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930449I24RikQ9D5E3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
4930449I24RikQ9D5E3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930449I24RikQ9D5E3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930449I24RikQ9D5E3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930449I24RikQ9D5E3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930449I24RikQ9D5E3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4930449I24RikQ9D5E3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4930449I24RikQ9D5E3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
4930449I24RikQ9D5E3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930449I24RikQ9D5E3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930449I24RikQ9D5E3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930449I24RikQ9D5E3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930449I24RikQ9D5E3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930449I24RikQ9D5E3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930449I24RikQ9D5E3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930449I24RikQ9D5E3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930449I24RikQ9D5E3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930449I24RikQ9D5E3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930449I24RikQ9D5E3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930449I24RikQ9D5E3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930449I24RikQ9D5E3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930449I24RikQ9D5E3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930449I24RikQ9D5E3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930449I24RikQ9D5E3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930449I24RikQ9D5E3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930449I24RikQ9D5E3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930449I24RikQ9D5E3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930449I24RikQ9D5E3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930449I24RikQ9D5E3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930449I24RikQ9D5E3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930449I24RikQ9D5E3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930449I24RikQ9D5E3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930449I24RikQ9D5E3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930449I24RikQ9D5E3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
4930449I24RikQ9D5E3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
4930449I24RikQ9D5E3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930449I24RikQ9D5E3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930449I24RikQ9D5E3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930449I24RikQ9D5E3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930449I24RikQ9D5E3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930449I24RikQ9D5E3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930449I24RikQ9D5E3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930449I24RikQ9D5E3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930449I24RikQ9D5E3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930449I24RikQ9D5E3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930449I24RikQ9D5E3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
4930449I24RikQ9D5E3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930449I24RikQ9D5E3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930449I24RikQ9D5E3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms