Protein–RNA interactions for Protein: Q9D593

Atp6v1e2, V-type proton ATPase subunit E 2, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v1e2Q9D593 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp6v1e2Q9D593 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp6v1e2Q9D593 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp6v1e2Q9D593 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp6v1e2Q9D593 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atp6v1e2Q9D593 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atp6v1e2Q9D593 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp6v1e2Q9D593 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp6v1e2Q9D593 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp6v1e2Q9D593 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp6v1e2Q9D593 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp6v1e2Q9D593 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp6v1e2Q9D593 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp6v1e2Q9D593 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp6v1e2Q9D593 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp6v1e2Q9D593 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp6v1e2Q9D593 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp6v1e2Q9D593 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp6v1e2Q9D593 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp6v1e2Q9D593 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp6v1e2Q9D593 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp6v1e2Q9D593 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp6v1e2Q9D593 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp6v1e2Q9D593 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp6v1e2Q9D593 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp6v1e2Q9D593 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp6v1e2Q9D593 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp6v1e2Q9D593 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp6v1e2Q9D593 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp6v1e2Q9D593 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp6v1e2Q9D593 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp6v1e2Q9D593 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp6v1e2Q9D593 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp6v1e2Q9D593 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp6v1e2Q9D593 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp6v1e2Q9D593 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp6v1e2Q9D593 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp6v1e2Q9D593 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp6v1e2Q9D593 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp6v1e2Q9D593 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp6v1e2Q9D593 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp6v1e2Q9D593 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp6v1e2Q9D593 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp6v1e2Q9D593 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp6v1e2Q9D593 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp6v1e2Q9D593 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp6v1e2Q9D593 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp6v1e2Q9D593 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp6v1e2Q9D593 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp6v1e2Q9D593 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp6v1e2Q9D593 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp6v1e2Q9D593 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp6v1e2Q9D593 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp6v1e2Q9D593 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp6v1e2Q9D593 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp6v1e2Q9D593 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp6v1e2Q9D593 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp6v1e2Q9D593 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp6v1e2Q9D593 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp6v1e2Q9D593 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp6v1e2Q9D593 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp6v1e2Q9D593 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atp6v1e2Q9D593 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atp6v1e2Q9D593 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp6v1e2Q9D593 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp6v1e2Q9D593 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp6v1e2Q9D593 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp6v1e2Q9D593 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp6v1e2Q9D593 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp6v1e2Q9D593 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp6v1e2Q9D593 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp6v1e2Q9D593 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp6v1e2Q9D593 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp6v1e2Q9D593 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp6v1e2Q9D593 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp6v1e2Q9D593 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp6v1e2Q9D593 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp6v1e2Q9D593 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp6v1e2Q9D593 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp6v1e2Q9D593 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp6v1e2Q9D593 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp6v1e2Q9D593 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp6v1e2Q9D593 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp6v1e2Q9D593 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp6v1e2Q9D593 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp6v1e2Q9D593 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp6v1e2Q9D593 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp6v1e2Q9D593 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp6v1e2Q9D593 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp6v1e2Q9D593 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp6v1e2Q9D593 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp6v1e2Q9D593 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp6v1e2Q9D593 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp6v1e2Q9D593 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp6v1e2Q9D593 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp6v1e2Q9D593 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp6v1e2Q9D593 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp6v1e2Q9D593 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp6v1e2Q9D593 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp6v1e2Q9D593 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms