Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3V5

Fsip1, Fibrous sheath-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fsip1Q9D3V5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fsip1Q9D3V5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fsip1Q9D3V5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fsip1Q9D3V5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fsip1Q9D3V5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fsip1Q9D3V5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fsip1Q9D3V5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fsip1Q9D3V5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fsip1Q9D3V5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fsip1Q9D3V5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fsip1Q9D3V5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fsip1Q9D3V5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fsip1Q9D3V5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fsip1Q9D3V5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fsip1Q9D3V5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fsip1Q9D3V5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fsip1Q9D3V5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fsip1Q9D3V5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fsip1Q9D3V5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fsip1Q9D3V5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fsip1Q9D3V5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fsip1Q9D3V5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fsip1Q9D3V5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fsip1Q9D3V5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fsip1Q9D3V5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fsip1Q9D3V5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fsip1Q9D3V5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fsip1Q9D3V5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fsip1Q9D3V5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fsip1Q9D3V5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fsip1Q9D3V5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Fsip1Q9D3V5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fsip1Q9D3V5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fsip1Q9D3V5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fsip1Q9D3V5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fsip1Q9D3V5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fsip1Q9D3V5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fsip1Q9D3V5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fsip1Q9D3V5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fsip1Q9D3V5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fsip1Q9D3V5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fsip1Q9D3V5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fsip1Q9D3V5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fsip1Q9D3V5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fsip1Q9D3V5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fsip1Q9D3V5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fsip1Q9D3V5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fsip1Q9D3V5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fsip1Q9D3V5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fsip1Q9D3V5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fsip1Q9D3V5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fsip1Q9D3V5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fsip1Q9D3V5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Fsip1Q9D3V5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Fsip1Q9D3V5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fsip1Q9D3V5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fsip1Q9D3V5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Fsip1Q9D3V5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fsip1Q9D3V5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Fsip1Q9D3V5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fsip1Q9D3V5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fsip1Q9D3V5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fsip1Q9D3V5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fsip1Q9D3V5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fsip1Q9D3V5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fsip1Q9D3V5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fsip1Q9D3V5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fsip1Q9D3V5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fsip1Q9D3V5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fsip1Q9D3V5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fsip1Q9D3V5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fsip1Q9D3V5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fsip1Q9D3V5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fsip1Q9D3V5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fsip1Q9D3V5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fsip1Q9D3V5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fsip1Q9D3V5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fsip1Q9D3V5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fsip1Q9D3V5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fsip1Q9D3V5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fsip1Q9D3V5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fsip1Q9D3V5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fsip1Q9D3V5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fsip1Q9D3V5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fsip1Q9D3V5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fsip1Q9D3V5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fsip1Q9D3V5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fsip1Q9D3V5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fsip1Q9D3V5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Fsip1Q9D3V5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fsip1Q9D3V5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fsip1Q9D3V5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fsip1Q9D3V5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fsip1Q9D3V5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fsip1Q9D3V5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Fsip1Q9D3V5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fsip1Q9D3V5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fsip1Q9D3V5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fsip1Q9D3V5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fsip1Q9D3V5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms