Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3G5

Stx11, Syntaxin-11, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx11Q9D3G5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx11Q9D3G5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx11Q9D3G5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx11Q9D3G5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx11Q9D3G5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx11Q9D3G5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx11Q9D3G5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx11Q9D3G5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx11Q9D3G5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx11Q9D3G5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx11Q9D3G5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx11Q9D3G5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx11Q9D3G5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx11Q9D3G5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx11Q9D3G5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx11Q9D3G5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx11Q9D3G5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx11Q9D3G5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx11Q9D3G5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx11Q9D3G5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx11Q9D3G5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx11Q9D3G5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx11Q9D3G5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx11Q9D3G5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx11Q9D3G5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx11Q9D3G5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx11Q9D3G5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx11Q9D3G5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stx11Q9D3G5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stx11Q9D3G5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stx11Q9D3G5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stx11Q9D3G5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx11Q9D3G5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx11Q9D3G5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx11Q9D3G5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx11Q9D3G5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx11Q9D3G5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx11Q9D3G5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx11Q9D3G5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx11Q9D3G5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx11Q9D3G5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx11Q9D3G5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx11Q9D3G5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stx11Q9D3G5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stx11Q9D3G5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Stx11Q9D3G5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx11Q9D3G5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx11Q9D3G5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx11Q9D3G5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx11Q9D3G5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx11Q9D3G5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx11Q9D3G5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx11Q9D3G5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx11Q9D3G5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stx11Q9D3G5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stx11Q9D3G5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stx11Q9D3G5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stx11Q9D3G5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stx11Q9D3G5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stx11Q9D3G5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Stx11Q9D3G5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stx11Q9D3G5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stx11Q9D3G5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stx11Q9D3G5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Stx11Q9D3G5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stx11Q9D3G5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Stx11Q9D3G5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stx11Q9D3G5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Stx11Q9D3G5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx11Q9D3G5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx11Q9D3G5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Stx11Q9D3G5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx11Q9D3G5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx11Q9D3G5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx11Q9D3G5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx11Q9D3G5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Stx11Q9D3G5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Stx11Q9D3G5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx11Q9D3G5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Stx11Q9D3G5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Stx11Q9D3G5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Stx11Q9D3G5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Stx11Q9D3G5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Stx11Q9D3G5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx11Q9D3G5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx11Q9D3G5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx11Q9D3G5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx11Q9D3G5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Stx11Q9D3G5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx11Q9D3G5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx11Q9D3G5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx11Q9D3G5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx11Q9D3G5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx11Q9D3G5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx11Q9D3G5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx11Q9D3G5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx11Q9D3G5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx11Q9D3G5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx11Q9D3G5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx11Q9D3G5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms