Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Necap2Q9D1J1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Necap2Q9D1J1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Necap2Q9D1J1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Necap2Q9D1J1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Necap2Q9D1J1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Necap2Q9D1J1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Necap2Q9D1J1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Necap2Q9D1J1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Necap2Q9D1J1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Necap2Q9D1J1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Necap2Q9D1J1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Necap2Q9D1J1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Necap2Q9D1J1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Necap2Q9D1J1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Necap2Q9D1J1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Necap2Q9D1J1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Necap2Q9D1J1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Necap2Q9D1J1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Necap2Q9D1J1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Necap2Q9D1J1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Necap2Q9D1J1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Necap2Q9D1J1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Necap2Q9D1J1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Necap2Q9D1J1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Necap2Q9D1J1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Necap2Q9D1J1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Necap2Q9D1J1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Necap2Q9D1J1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Necap2Q9D1J1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Necap2Q9D1J1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Necap2Q9D1J1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Necap2Q9D1J1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Necap2Q9D1J1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Necap2Q9D1J1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Necap2Q9D1J1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Necap2Q9D1J1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Necap2Q9D1J1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Necap2Q9D1J1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Necap2Q9D1J1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Necap2Q9D1J1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Necap2Q9D1J1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Necap2Q9D1J1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Necap2Q9D1J1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Necap2Q9D1J1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Necap2Q9D1J1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Necap2Q9D1J1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Necap2Q9D1J1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Necap2Q9D1J1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Necap2Q9D1J1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Necap2Q9D1J1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Necap2Q9D1J1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Necap2Q9D1J1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Necap2Q9D1J1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Necap2Q9D1J1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Necap2Q9D1J1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Necap2Q9D1J1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms