Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc80Q9D0F1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndc80Q9D0F1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndc80Q9D0F1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndc80Q9D0F1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndc80Q9D0F1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndc80Q9D0F1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndc80Q9D0F1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndc80Q9D0F1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndc80Q9D0F1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndc80Q9D0F1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndc80Q9D0F1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndc80Q9D0F1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndc80Q9D0F1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndc80Q9D0F1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndc80Q9D0F1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndc80Q9D0F1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndc80Q9D0F1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndc80Q9D0F1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndc80Q9D0F1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndc80Q9D0F1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndc80Q9D0F1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndc80Q9D0F1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndc80Q9D0F1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndc80Q9D0F1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndc80Q9D0F1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndc80Q9D0F1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndc80Q9D0F1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ndc80Q9D0F1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ndc80Q9D0F1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ndc80Q9D0F1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ndc80Q9D0F1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndc80Q9D0F1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndc80Q9D0F1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndc80Q9D0F1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndc80Q9D0F1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndc80Q9D0F1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndc80Q9D0F1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndc80Q9D0F1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndc80Q9D0F1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndc80Q9D0F1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndc80Q9D0F1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndc80Q9D0F1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndc80Q9D0F1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndc80Q9D0F1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndc80Q9D0F1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndc80Q9D0F1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndc80Q9D0F1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndc80Q9D0F1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndc80Q9D0F1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndc80Q9D0F1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndc80Q9D0F1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndc80Q9D0F1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndc80Q9D0F1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndc80Q9D0F1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndc80Q9D0F1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndc80Q9D0F1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndc80Q9D0F1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndc80Q9D0F1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndc80Q9D0F1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndc80Q9D0F1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndc80Q9D0F1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndc80Q9D0F1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ndc80Q9D0F1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndc80Q9D0F1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndc80Q9D0F1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndc80Q9D0F1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndc80Q9D0F1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndc80Q9D0F1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndc80Q9D0F1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndc80Q9D0F1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndc80Q9D0F1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndc80Q9D0F1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndc80Q9D0F1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndc80Q9D0F1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndc80Q9D0F1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndc80Q9D0F1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndc80Q9D0F1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndc80Q9D0F1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndc80Q9D0F1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndc80Q9D0F1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndc80Q9D0F1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndc80Q9D0F1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndc80Q9D0F1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndc80Q9D0F1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndc80Q9D0F1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndc80Q9D0F1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndc80Q9D0F1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndc80Q9D0F1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndc80Q9D0F1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndc80Q9D0F1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndc80Q9D0F1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ndc80Q9D0F1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndc80Q9D0F1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndc80Q9D0F1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndc80Q9D0F1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndc80Q9D0F1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndc80Q9D0F1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndc80Q9D0F1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndc80Q9D0F1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndc80Q9D0F1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
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