Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnajc18Q9CZJ9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Dnajc18Q9CZJ9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dnajc18Q9CZJ9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dnajc18Q9CZJ9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dnajc18Q9CZJ9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dnajc18Q9CZJ9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dnajc18Q9CZJ9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dnajc18Q9CZJ9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dnajc18Q9CZJ9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dnajc18Q9CZJ9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dnajc18Q9CZJ9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dnajc18Q9CZJ9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dnajc18Q9CZJ9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dnajc18Q9CZJ9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dnajc18Q9CZJ9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dnajc18Q9CZJ9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dnajc18Q9CZJ9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dnajc18Q9CZJ9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnajc18Q9CZJ9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnajc18Q9CZJ9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnajc18Q9CZJ9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnajc18Q9CZJ9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnajc18Q9CZJ9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnajc18Q9CZJ9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnajc18Q9CZJ9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dnajc18Q9CZJ9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dnajc18Q9CZJ9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dnajc18Q9CZJ9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dnajc18Q9CZJ9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dnajc18Q9CZJ9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dnajc18Q9CZJ9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dnajc18Q9CZJ9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dnajc18Q9CZJ9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dnajc18Q9CZJ9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dnajc18Q9CZJ9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnajc18Q9CZJ9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnajc18Q9CZJ9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnajc18Q9CZJ9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnajc18Q9CZJ9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnajc18Q9CZJ9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnajc18Q9CZJ9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnajc18Q9CZJ9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnajc18Q9CZJ9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnajc18Q9CZJ9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnajc18Q9CZJ9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnajc18Q9CZJ9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnajc18Q9CZJ9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnajc18Q9CZJ9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnajc18Q9CZJ9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnajc18Q9CZJ9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnajc18Q9CZJ9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnajc18Q9CZJ9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dnajc18Q9CZJ9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dnajc18Q9CZJ9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnajc18Q9CZJ9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnajc18Q9CZJ9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnajc18Q9CZJ9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnajc18Q9CZJ9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnajc18Q9CZJ9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnajc18Q9CZJ9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnajc18Q9CZJ9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnajc18Q9CZJ9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnajc18Q9CZJ9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnajc18Q9CZJ9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnajc18Q9CZJ9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnajc18Q9CZJ9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnajc18Q9CZJ9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnajc18Q9CZJ9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnajc18Q9CZJ9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnajc18Q9CZJ9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnajc18Q9CZJ9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnajc18Q9CZJ9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnajc18Q9CZJ9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnajc18Q9CZJ9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnajc18Q9CZJ9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnajc18Q9CZJ9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnajc18Q9CZJ9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnajc18Q9CZJ9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnajc18Q9CZJ9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dnajc18Q9CZJ9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Dnajc18Q9CZJ9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dnajc18Q9CZJ9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dnajc18Q9CZJ9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dnajc18Q9CZJ9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnajc18Q9CZJ9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnajc18Q9CZJ9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnajc18Q9CZJ9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnajc18Q9CZJ9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnajc18Q9CZJ9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnajc18Q9CZJ9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnajc18Q9CZJ9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnajc18Q9CZJ9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnajc18Q9CZJ9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnajc18Q9CZJ9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnajc18Q9CZJ9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms