Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZG3

Commd8, COMM domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd8Q9CZG3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Commd8Q9CZG3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Commd8Q9CZG3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Commd8Q9CZG3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Commd8Q9CZG3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Commd8Q9CZG3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Commd8Q9CZG3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Commd8Q9CZG3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Commd8Q9CZG3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Commd8Q9CZG3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Commd8Q9CZG3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Commd8Q9CZG3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Commd8Q9CZG3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Commd8Q9CZG3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Commd8Q9CZG3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Commd8Q9CZG3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Commd8Q9CZG3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Commd8Q9CZG3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Commd8Q9CZG3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Commd8Q9CZG3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Commd8Q9CZG3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Commd8Q9CZG3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Commd8Q9CZG3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Commd8Q9CZG3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Commd8Q9CZG3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Commd8Q9CZG3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Commd8Q9CZG3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Commd8Q9CZG3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Commd8Q9CZG3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Commd8Q9CZG3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Commd8Q9CZG3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Commd8Q9CZG3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Commd8Q9CZG3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Commd8Q9CZG3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Commd8Q9CZG3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Commd8Q9CZG3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Commd8Q9CZG3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Commd8Q9CZG3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Commd8Q9CZG3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Commd8Q9CZG3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Commd8Q9CZG3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Commd8Q9CZG3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Commd8Q9CZG3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Commd8Q9CZG3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Commd8Q9CZG3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Commd8Q9CZG3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Commd8Q9CZG3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Commd8Q9CZG3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Commd8Q9CZG3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Commd8Q9CZG3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Commd8Q9CZG3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Commd8Q9CZG3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Commd8Q9CZG3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Commd8Q9CZG3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Commd8Q9CZG3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Commd8Q9CZG3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Commd8Q9CZG3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Commd8Q9CZG3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Commd8Q9CZG3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Commd8Q9CZG3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Commd8Q9CZG3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Commd8Q9CZG3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Commd8Q9CZG3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Commd8Q9CZG3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Commd8Q9CZG3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Commd8Q9CZG3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Commd8Q9CZG3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Commd8Q9CZG3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Commd8Q9CZG3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Commd8Q9CZG3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Commd8Q9CZG3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Commd8Q9CZG3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Commd8Q9CZG3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Commd8Q9CZG3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Commd8Q9CZG3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Commd8Q9CZG3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Commd8Q9CZG3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Commd8Q9CZG3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Commd8Q9CZG3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Commd8Q9CZG3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Commd8Q9CZG3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Commd8Q9CZG3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Commd8Q9CZG3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Commd8Q9CZG3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Commd8Q9CZG3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Commd8Q9CZG3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Commd8Q9CZG3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Commd8Q9CZG3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Commd8Q9CZG3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Commd8Q9CZG3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Commd8Q9CZG3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Commd8Q9CZG3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Commd8Q9CZG3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Commd8Q9CZG3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Commd8Q9CZG3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Commd8Q9CZG3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Commd8Q9CZG3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Commd8Q9CZG3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Commd8Q9CZG3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Commd8Q9CZG3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms