Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Thumpd2Q9CZB3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Thumpd2Q9CZB3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Thumpd2Q9CZB3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Thumpd2Q9CZB3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Thumpd2Q9CZB3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Thumpd2Q9CZB3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Thumpd2Q9CZB3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Thumpd2Q9CZB3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Thumpd2Q9CZB3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Thumpd2Q9CZB3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Thumpd2Q9CZB3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Thumpd2Q9CZB3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Thumpd2Q9CZB3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Thumpd2Q9CZB3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Thumpd2Q9CZB3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Thumpd2Q9CZB3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Thumpd2Q9CZB3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Thumpd2Q9CZB3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Thumpd2Q9CZB3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Thumpd2Q9CZB3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Thumpd2Q9CZB3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Thumpd2Q9CZB3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Thumpd2Q9CZB3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Thumpd2Q9CZB3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Thumpd2Q9CZB3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Thumpd2Q9CZB3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Thumpd2Q9CZB3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Thumpd2Q9CZB3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Thumpd2Q9CZB3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Thumpd2Q9CZB3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Thumpd2Q9CZB3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Thumpd2Q9CZB3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Thumpd2Q9CZB3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Thumpd2Q9CZB3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Thumpd2Q9CZB3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Thumpd2Q9CZB3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Thumpd2Q9CZB3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Thumpd2Q9CZB3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Thumpd2Q9CZB3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Thumpd2Q9CZB3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Thumpd2Q9CZB3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Thumpd2Q9CZB3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Thumpd2Q9CZB3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Thumpd2Q9CZB3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Thumpd2Q9CZB3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Thumpd2Q9CZB3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Thumpd2Q9CZB3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Thumpd2Q9CZB3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Thumpd2Q9CZB3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Thumpd2Q9CZB3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Thumpd2Q9CZB3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Thumpd2Q9CZB3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Thumpd2Q9CZB3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Thumpd2Q9CZB3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Thumpd2Q9CZB3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Thumpd2Q9CZB3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Thumpd2Q9CZB3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Thumpd2Q9CZB3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Thumpd2Q9CZB3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Thumpd2Q9CZB3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Thumpd2Q9CZB3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Thumpd2Q9CZB3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Thumpd2Q9CZB3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Thumpd2Q9CZB3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Thumpd2Q9CZB3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Thumpd2Q9CZB3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Thumpd2Q9CZB3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Thumpd2Q9CZB3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Thumpd2Q9CZB3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Thumpd2Q9CZB3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Thumpd2Q9CZB3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Thumpd2Q9CZB3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Thumpd2Q9CZB3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Thumpd2Q9CZB3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Thumpd2Q9CZB3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Thumpd2Q9CZB3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Thumpd2Q9CZB3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Thumpd2Q9CZB3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Thumpd2Q9CZB3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Thumpd2Q9CZB3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Thumpd2Q9CZB3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Thumpd2Q9CZB3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Thumpd2Q9CZB3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Thumpd2Q9CZB3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Thumpd2Q9CZB3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Thumpd2Q9CZB3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Thumpd2Q9CZB3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Thumpd2Q9CZB3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Thumpd2Q9CZB3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Thumpd2Q9CZB3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Thumpd2Q9CZB3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Thumpd2Q9CZB3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Thumpd2Q9CZB3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Thumpd2Q9CZB3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Thumpd2Q9CZB3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Thumpd2Q9CZB3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Thumpd2Q9CZB3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Thumpd2Q9CZB3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Thumpd2Q9CZB3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms