Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmem39aQ9CYC3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmem39aQ9CYC3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmem39aQ9CYC3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmem39aQ9CYC3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem39aQ9CYC3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmem39aQ9CYC3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmem39aQ9CYC3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmem39aQ9CYC3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmem39aQ9CYC3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmem39aQ9CYC3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmem39aQ9CYC3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmem39aQ9CYC3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmem39aQ9CYC3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmem39aQ9CYC3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmem39aQ9CYC3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tmem39aQ9CYC3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmem39aQ9CYC3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem39aQ9CYC3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem39aQ9CYC3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem39aQ9CYC3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem39aQ9CYC3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem39aQ9CYC3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem39aQ9CYC3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem39aQ9CYC3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem39aQ9CYC3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem39aQ9CYC3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem39aQ9CYC3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem39aQ9CYC3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem39aQ9CYC3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem39aQ9CYC3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem39aQ9CYC3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem39aQ9CYC3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem39aQ9CYC3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem39aQ9CYC3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem39aQ9CYC3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem39aQ9CYC3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem39aQ9CYC3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem39aQ9CYC3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem39aQ9CYC3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem39aQ9CYC3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem39aQ9CYC3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmem39aQ9CYC3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmem39aQ9CYC3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem39aQ9CYC3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem39aQ9CYC3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem39aQ9CYC3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem39aQ9CYC3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem39aQ9CYC3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem39aQ9CYC3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmem39aQ9CYC3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmem39aQ9CYC3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem39aQ9CYC3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem39aQ9CYC3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem39aQ9CYC3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem39aQ9CYC3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem39aQ9CYC3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem39aQ9CYC3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem39aQ9CYC3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem39aQ9CYC3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmem39aQ9CYC3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tmem39aQ9CYC3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tmem39aQ9CYC3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms