Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufaf1Q9CWX2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufaf1Q9CWX2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufaf1Q9CWX2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufaf1Q9CWX2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufaf1Q9CWX2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufaf1Q9CWX2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufaf1Q9CWX2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufaf1Q9CWX2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufaf1Q9CWX2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufaf1Q9CWX2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufaf1Q9CWX2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufaf1Q9CWX2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufaf1Q9CWX2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufaf1Q9CWX2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufaf1Q9CWX2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufaf1Q9CWX2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufaf1Q9CWX2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufaf1Q9CWX2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufaf1Q9CWX2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufaf1Q9CWX2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufaf1Q9CWX2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufaf1Q9CWX2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ndufaf1Q9CWX2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufaf1Q9CWX2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufaf1Q9CWX2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufaf1Q9CWX2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufaf1Q9CWX2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufaf1Q9CWX2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufaf1Q9CWX2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufaf1Q9CWX2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufaf1Q9CWX2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufaf1Q9CWX2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufaf1Q9CWX2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufaf1Q9CWX2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufaf1Q9CWX2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufaf1Q9CWX2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufaf1Q9CWX2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufaf1Q9CWX2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufaf1Q9CWX2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufaf1Q9CWX2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufaf1Q9CWX2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufaf1Q9CWX2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufaf1Q9CWX2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufaf1Q9CWX2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufaf1Q9CWX2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufaf1Q9CWX2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufaf1Q9CWX2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufaf1Q9CWX2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufaf1Q9CWX2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufaf1Q9CWX2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufaf1Q9CWX2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ndufaf1Q9CWX2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ndufaf1Q9CWX2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ndufaf1Q9CWX2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ndufaf1Q9CWX2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ndufaf1Q9CWX2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ndufaf1Q9CWX2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ndufaf1Q9CWX2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufaf1Q9CWX2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufaf1Q9CWX2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufaf1Q9CWX2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufaf1Q9CWX2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufaf1Q9CWX2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufaf1Q9CWX2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufaf1Q9CWX2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufaf1Q9CWX2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufaf1Q9CWX2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufaf1Q9CWX2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufaf1Q9CWX2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufaf1Q9CWX2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufaf1Q9CWX2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufaf1Q9CWX2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufaf1Q9CWX2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufaf1Q9CWX2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufaf1Q9CWX2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufaf1Q9CWX2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufaf1Q9CWX2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufaf1Q9CWX2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufaf1Q9CWX2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufaf1Q9CWX2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms