Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWL8

Ctnnbl1, Beta-catenin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbl1Q9CWL8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctnnbl1Q9CWL8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctnnbl1Q9CWL8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctnnbl1Q9CWL8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctnnbl1Q9CWL8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctnnbl1Q9CWL8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctnnbl1Q9CWL8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctnnbl1Q9CWL8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctnnbl1Q9CWL8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctnnbl1Q9CWL8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctnnbl1Q9CWL8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctnnbl1Q9CWL8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctnnbl1Q9CWL8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctnnbl1Q9CWL8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctnnbl1Q9CWL8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctnnbl1Q9CWL8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctnnbl1Q9CWL8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctnnbl1Q9CWL8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctnnbl1Q9CWL8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctnnbl1Q9CWL8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctnnbl1Q9CWL8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctnnbl1Q9CWL8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctnnbl1Q9CWL8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctnnbl1Q9CWL8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctnnbl1Q9CWL8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctnnbl1Q9CWL8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctnnbl1Q9CWL8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctnnbl1Q9CWL8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctnnbl1Q9CWL8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ctnnbl1Q9CWL8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctnnbl1Q9CWL8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctnnbl1Q9CWL8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctnnbl1Q9CWL8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctnnbl1Q9CWL8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctnnbl1Q9CWL8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctnnbl1Q9CWL8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctnnbl1Q9CWL8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctnnbl1Q9CWL8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctnnbl1Q9CWL8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctnnbl1Q9CWL8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctnnbl1Q9CWL8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctnnbl1Q9CWL8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctnnbl1Q9CWL8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ctnnbl1Q9CWL8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnnbl1Q9CWL8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnnbl1Q9CWL8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctnnbl1Q9CWL8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctnnbl1Q9CWL8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctnnbl1Q9CWL8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctnnbl1Q9CWL8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctnnbl1Q9CWL8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctnnbl1Q9CWL8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctnnbl1Q9CWL8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ctnnbl1Q9CWL8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ctnnbl1Q9CWL8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms