Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PclafQ9CQX4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PclafQ9CQX4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PclafQ9CQX4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PclafQ9CQX4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PclafQ9CQX4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PclafQ9CQX4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PclafQ9CQX4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PclafQ9CQX4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PclafQ9CQX4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PclafQ9CQX4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PclafQ9CQX4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PclafQ9CQX4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PclafQ9CQX4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PclafQ9CQX4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PclafQ9CQX4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PclafQ9CQX4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PclafQ9CQX4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PclafQ9CQX4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PclafQ9CQX4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PclafQ9CQX4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PclafQ9CQX4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PclafQ9CQX4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PclafQ9CQX4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PclafQ9CQX4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PclafQ9CQX4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PclafQ9CQX4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PclafQ9CQX4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PclafQ9CQX4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PclafQ9CQX4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PclafQ9CQX4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PclafQ9CQX4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PclafQ9CQX4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PclafQ9CQX4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PclafQ9CQX4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PclafQ9CQX4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PclafQ9CQX4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PclafQ9CQX4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PclafQ9CQX4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PclafQ9CQX4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PclafQ9CQX4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PclafQ9CQX4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PclafQ9CQX4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PclafQ9CQX4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PclafQ9CQX4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PclafQ9CQX4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PclafQ9CQX4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PclafQ9CQX4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PclafQ9CQX4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PclafQ9CQX4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PclafQ9CQX4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PclafQ9CQX4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PclafQ9CQX4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PclafQ9CQX4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PclafQ9CQX4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PclafQ9CQX4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PclafQ9CQX4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PclafQ9CQX4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PclafQ9CQX4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PclafQ9CQX4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PclafQ9CQX4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PclafQ9CQX4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PclafQ9CQX4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PclafQ9CQX4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PclafQ9CQX4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PclafQ9CQX4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PclafQ9CQX4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PclafQ9CQX4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PclafQ9CQX4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PclafQ9CQX4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PclafQ9CQX4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PclafQ9CQX4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PclafQ9CQX4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PclafQ9CQX4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms