Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF8

Mrpl57, Ribosomal protein 63, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl57Q9CQF8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mrpl57Q9CQF8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Mrpl57Q9CQF8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mrpl57Q9CQF8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl57Q9CQF8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl57Q9CQF8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl57Q9CQF8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl57Q9CQF8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl57Q9CQF8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl57Q9CQF8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mrpl57Q9CQF8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mrpl57Q9CQF8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Mrpl57Q9CQF8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrpl57Q9CQF8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrpl57Q9CQF8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrpl57Q9CQF8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrpl57Q9CQF8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrpl57Q9CQF8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrpl57Q9CQF8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrpl57Q9CQF8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrpl57Q9CQF8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrpl57Q9CQF8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrpl57Q9CQF8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrpl57Q9CQF8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrpl57Q9CQF8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrpl57Q9CQF8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrpl57Q9CQF8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrpl57Q9CQF8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrpl57Q9CQF8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrpl57Q9CQF8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrpl57Q9CQF8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrpl57Q9CQF8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrpl57Q9CQF8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrpl57Q9CQF8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl57Q9CQF8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl57Q9CQF8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl57Q9CQF8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl57Q9CQF8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl57Q9CQF8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl57Q9CQF8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl57Q9CQF8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl57Q9CQF8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl57Q9CQF8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl57Q9CQF8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl57Q9CQF8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrpl57Q9CQF8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrpl57Q9CQF8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrpl57Q9CQF8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrpl57Q9CQF8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrpl57Q9CQF8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl57Q9CQF8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl57Q9CQF8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrpl57Q9CQF8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrpl57Q9CQF8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl57Q9CQF8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl57Q9CQF8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl57Q9CQF8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl57Q9CQF8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl57Q9CQF8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl57Q9CQF8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl57Q9CQF8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl57Q9CQF8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Mrpl57Q9CQF8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrpl57Q9CQF8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrpl57Q9CQF8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrpl57Q9CQF8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrpl57Q9CQF8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mrpl57Q9CQF8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrpl57Q9CQF8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrpl57Q9CQF8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrpl57Q9CQF8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl57Q9CQF8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl57Q9CQF8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl57Q9CQF8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl57Q9CQF8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl57Q9CQF8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl57Q9CQF8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrpl57Q9CQF8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrpl57Q9CQF8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrpl57Q9CQF8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrpl57Q9CQF8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mrpl57Q9CQF8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mrpl57Q9CQF8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mrpl57Q9CQF8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrpl57Q9CQF8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrpl57Q9CQF8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrpl57Q9CQF8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl57Q9CQF8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl57Q9CQF8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl57Q9CQF8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl57Q9CQF8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl57Q9CQF8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl57Q9CQF8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl57Q9CQF8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl57Q9CQF8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl57Q9CQF8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl57Q9CQF8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl57Q9CQF8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl57Q9CQF8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl57Q9CQF8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms