Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atg3Q9CPX6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atg3Q9CPX6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atg3Q9CPX6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atg3Q9CPX6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Atg3Q9CPX6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Atg3Q9CPX6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Atg3Q9CPX6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Atg3Q9CPX6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atg3Q9CPX6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Atg3Q9CPX6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atg3Q9CPX6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Atg3Q9CPX6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atg3Q9CPX6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atg3Q9CPX6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atg3Q9CPX6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Atg3Q9CPX6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atg3Q9CPX6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atg3Q9CPX6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atg3Q9CPX6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atg3Q9CPX6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atg3Q9CPX6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atg3Q9CPX6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atg3Q9CPX6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atg3Q9CPX6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atg3Q9CPX6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atg3Q9CPX6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atg3Q9CPX6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atg3Q9CPX6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atg3Q9CPX6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atg3Q9CPX6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atg3Q9CPX6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atg3Q9CPX6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atg3Q9CPX6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atg3Q9CPX6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atg3Q9CPX6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atg3Q9CPX6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atg3Q9CPX6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atg3Q9CPX6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atg3Q9CPX6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Atg3Q9CPX6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Atg3Q9CPX6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atg3Q9CPX6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atg3Q9CPX6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atg3Q9CPX6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atg3Q9CPX6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atg3Q9CPX6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atg3Q9CPX6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atg3Q9CPX6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atg3Q9CPX6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atg3Q9CPX6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atg3Q9CPX6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atg3Q9CPX6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atg3Q9CPX6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atg3Q9CPX6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atg3Q9CPX6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atg3Q9CPX6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atg3Q9CPX6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atg3Q9CPX6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atg3Q9CPX6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atg3Q9CPX6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atg3Q9CPX6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atg3Q9CPX6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atg3Q9CPX6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atg3Q9CPX6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atg3Q9CPX6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Atg3Q9CPX6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atg3Q9CPX6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atg3Q9CPX6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atg3Q9CPX6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atg3Q9CPX6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atg3Q9CPX6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Atg3Q9CPX6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Atg3Q9CPX6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Atg3Q9CPX6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Atg3Q9CPX6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atg3Q9CPX6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atg3Q9CPX6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atg3Q9CPX6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atg3Q9CPX6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Atg3Q9CPX6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atg3Q9CPX6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atg3Q9CPX6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Atg3Q9CPX6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Atg3Q9CPX6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Atg3Q9CPX6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Atg3Q9CPX6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atg3Q9CPX6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atg3Q9CPX6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atg3Q9CPX6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Atg3Q9CPX6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atg3Q9CPX6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atg3Q9CPX6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Atg3Q9CPX6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Atg3Q9CPX6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Atg3Q9CPX6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Atg3Q9CPX6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atg3Q9CPX6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Atg3Q9CPX6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Atg3Q9CPX6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms