Protein–RNA interactions for Protein: Q99PH1

Lrrc4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4Q99PH1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc4Q99PH1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc4Q99PH1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc4Q99PH1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc4Q99PH1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc4Q99PH1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc4Q99PH1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc4Q99PH1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc4Q99PH1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc4Q99PH1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc4Q99PH1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc4Q99PH1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc4Q99PH1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc4Q99PH1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc4Q99PH1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc4Q99PH1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc4Q99PH1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc4Q99PH1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc4Q99PH1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc4Q99PH1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc4Q99PH1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc4Q99PH1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc4Q99PH1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc4Q99PH1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc4Q99PH1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc4Q99PH1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc4Q99PH1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc4Q99PH1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc4Q99PH1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc4Q99PH1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc4Q99PH1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc4Q99PH1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc4Q99PH1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc4Q99PH1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc4Q99PH1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc4Q99PH1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc4Q99PH1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc4Q99PH1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc4Q99PH1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc4Q99PH1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc4Q99PH1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc4Q99PH1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc4Q99PH1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc4Q99PH1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc4Q99PH1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc4Q99PH1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc4Q99PH1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc4Q99PH1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc4Q99PH1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc4Q99PH1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc4Q99PH1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc4Q99PH1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc4Q99PH1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc4Q99PH1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrc4Q99PH1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrc4Q99PH1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc4Q99PH1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc4Q99PH1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc4Q99PH1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc4Q99PH1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc4Q99PH1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc4Q99PH1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc4Q99PH1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc4Q99PH1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc4Q99PH1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc4Q99PH1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc4Q99PH1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc4Q99PH1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc4Q99PH1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc4Q99PH1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc4Q99PH1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc4Q99PH1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc4Q99PH1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc4Q99PH1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc4Q99PH1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc4Q99PH1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc4Q99PH1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc4Q99PH1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc4Q99PH1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc4Q99PH1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc4Q99PH1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc4Q99PH1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc4Q99PH1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc4Q99PH1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc4Q99PH1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc4Q99PH1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc4Q99PH1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc4Q99PH1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc4Q99PH1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc4Q99PH1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc4Q99PH1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc4Q99PH1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc4Q99PH1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc4Q99PH1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc4Q99PH1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc4Q99PH1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc4Q99PH1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc4Q99PH1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc4Q99PH1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc4Q99PH1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.8 ms