Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME2

Wdr6, WD repeat-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr6Q99ME2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Wdr6Q99ME2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Wdr6Q99ME2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Wdr6Q99ME2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Wdr6Q99ME2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Wdr6Q99ME2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Wdr6Q99ME2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Wdr6Q99ME2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Wdr6Q99ME2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Wdr6Q99ME2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Wdr6Q99ME2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Wdr6Q99ME2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Wdr6Q99ME2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Wdr6Q99ME2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Wdr6Q99ME2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Wdr6Q99ME2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Wdr6Q99ME2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Wdr6Q99ME2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Wdr6Q99ME2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Wdr6Q99ME2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Wdr6Q99ME2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Wdr6Q99ME2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wdr6Q99ME2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wdr6Q99ME2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wdr6Q99ME2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wdr6Q99ME2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Wdr6Q99ME2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Wdr6Q99ME2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Wdr6Q99ME2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Wdr6Q99ME2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Wdr6Q99ME2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Wdr6Q99ME2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Wdr6Q99ME2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Wdr6Q99ME2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Wdr6Q99ME2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Wdr6Q99ME2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Wdr6Q99ME2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Wdr6Q99ME2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Wdr6Q99ME2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Wdr6Q99ME2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Wdr6Q99ME2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Wdr6Q99ME2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Wdr6Q99ME2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Wdr6Q99ME2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Wdr6Q99ME2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Wdr6Q99ME2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Wdr6Q99ME2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Wdr6Q99ME2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Wdr6Q99ME2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Wdr6Q99ME2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Wdr6Q99ME2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Wdr6Q99ME2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Wdr6Q99ME2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Wdr6Q99ME2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Wdr6Q99ME2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Wdr6Q99ME2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Wdr6Q99ME2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Wdr6Q99ME2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Wdr6Q99ME2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Wdr6Q99ME2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Wdr6Q99ME2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Wdr6Q99ME2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Wdr6Q99ME2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Wdr6Q99ME2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Wdr6Q99ME2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Wdr6Q99ME2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Wdr6Q99ME2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Wdr6Q99ME2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Wdr6Q99ME2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Wdr6Q99ME2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Wdr6Q99ME2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Wdr6Q99ME2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Wdr6Q99ME2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Wdr6Q99ME2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Wdr6Q99ME2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Wdr6Q99ME2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Wdr6Q99ME2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Wdr6Q99ME2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Wdr6Q99ME2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Wdr6Q99ME2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Wdr6Q99ME2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Wdr6Q99ME2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Wdr6Q99ME2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Wdr6Q99ME2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Wdr6Q99ME2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Wdr6Q99ME2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Wdr6Q99ME2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Wdr6Q99ME2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Wdr6Q99ME2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Wdr6Q99ME2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Wdr6Q99ME2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Wdr6Q99ME2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Wdr6Q99ME2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Wdr6Q99ME2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdr6Q99ME2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdr6Q99ME2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdr6Q99ME2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdr6Q99ME2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdr6Q99ME2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdr6Q99ME2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms