Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp1b1Q99LU0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp1b1Q99LU0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp1b1Q99LU0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp1b1Q99LU0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp1b1Q99LU0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp1b1Q99LU0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp1b1Q99LU0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp1b1Q99LU0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp1b1Q99LU0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp1b1Q99LU0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp1b1Q99LU0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp1b1Q99LU0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp1b1Q99LU0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp1b1Q99LU0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp1b1Q99LU0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp1b1Q99LU0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp1b1Q99LU0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp1b1Q99LU0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp1b1Q99LU0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp1b1Q99LU0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp1b1Q99LU0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp1b1Q99LU0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp1b1Q99LU0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp1b1Q99LU0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Chmp1b1Q99LU0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp1b1Q99LU0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp1b1Q99LU0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp1b1Q99LU0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp1b1Q99LU0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp1b1Q99LU0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp1b1Q99LU0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp1b1Q99LU0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp1b1Q99LU0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp1b1Q99LU0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp1b1Q99LU0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp1b1Q99LU0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp1b1Q99LU0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp1b1Q99LU0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp1b1Q99LU0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp1b1Q99LU0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp1b1Q99LU0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp1b1Q99LU0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp1b1Q99LU0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp1b1Q99LU0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp1b1Q99LU0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp1b1Q99LU0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp1b1Q99LU0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp1b1Q99LU0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp1b1Q99LU0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp1b1Q99LU0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp1b1Q99LU0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp1b1Q99LU0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chmp1b1Q99LU0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp1b1Q99LU0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp1b1Q99LU0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp1b1Q99LU0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp1b1Q99LU0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp1b1Q99LU0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp1b1Q99LU0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp1b1Q99LU0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp1b1Q99LU0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp1b1Q99LU0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp1b1Q99LU0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp1b1Q99LU0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp1b1Q99LU0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp1b1Q99LU0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp1b1Q99LU0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp1b1Q99LU0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp1b1Q99LU0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp1b1Q99LU0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp1b1Q99LU0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp1b1Q99LU0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp1b1Q99LU0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp1b1Q99LU0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp1b1Q99LU0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp1b1Q99LU0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp1b1Q99LU0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chmp1b1Q99LU0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chmp1b1Q99LU0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp1b1Q99LU0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp1b1Q99LU0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp1b1Q99LU0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp1b1Q99LU0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp1b1Q99LU0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp1b1Q99LU0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp1b1Q99LU0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp1b1Q99LU0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp1b1Q99LU0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp1b1Q99LU0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp1b1Q99LU0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp1b1Q99LU0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp1b1Q99LU0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp1b1Q99LU0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp1b1Q99LU0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp1b1Q99LU0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp1b1Q99LU0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp1b1Q99LU0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp1b1Q99LU0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp1b1Q99LU0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms