Protein–RNA interactions for Protein: Q99LC5

Etfa, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EtfaQ99LC5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EtfaQ99LC5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EtfaQ99LC5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EtfaQ99LC5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EtfaQ99LC5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EtfaQ99LC5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EtfaQ99LC5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EtfaQ99LC5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EtfaQ99LC5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EtfaQ99LC5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EtfaQ99LC5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EtfaQ99LC5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EtfaQ99LC5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EtfaQ99LC5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EtfaQ99LC5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EtfaQ99LC5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EtfaQ99LC5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EtfaQ99LC5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EtfaQ99LC5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EtfaQ99LC5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EtfaQ99LC5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EtfaQ99LC5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EtfaQ99LC5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EtfaQ99LC5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EtfaQ99LC5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EtfaQ99LC5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EtfaQ99LC5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EtfaQ99LC5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EtfaQ99LC5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EtfaQ99LC5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EtfaQ99LC5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EtfaQ99LC5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EtfaQ99LC5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EtfaQ99LC5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EtfaQ99LC5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EtfaQ99LC5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EtfaQ99LC5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EtfaQ99LC5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EtfaQ99LC5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EtfaQ99LC5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EtfaQ99LC5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EtfaQ99LC5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EtfaQ99LC5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EtfaQ99LC5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EtfaQ99LC5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EtfaQ99LC5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EtfaQ99LC5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EtfaQ99LC5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EtfaQ99LC5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EtfaQ99LC5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EtfaQ99LC5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EtfaQ99LC5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EtfaQ99LC5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EtfaQ99LC5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EtfaQ99LC5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EtfaQ99LC5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EtfaQ99LC5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EtfaQ99LC5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EtfaQ99LC5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EtfaQ99LC5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EtfaQ99LC5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EtfaQ99LC5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EtfaQ99LC5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EtfaQ99LC5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EtfaQ99LC5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms