Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Pagr1aQ99L02 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pagr1aQ99L02 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pagr1aQ99L02 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pagr1aQ99L02 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pagr1aQ99L02 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pagr1aQ99L02 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pagr1aQ99L02 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pagr1aQ99L02 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pagr1aQ99L02 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pagr1aQ99L02 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pagr1aQ99L02 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pagr1aQ99L02 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pagr1aQ99L02 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pagr1aQ99L02 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pagr1aQ99L02 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pagr1aQ99L02 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pagr1aQ99L02 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pagr1aQ99L02 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pagr1aQ99L02 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pagr1aQ99L02 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Pagr1aQ99L02 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pagr1aQ99L02 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pagr1aQ99L02 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pagr1aQ99L02 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pagr1aQ99L02 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pagr1aQ99L02 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pagr1aQ99L02 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pagr1aQ99L02 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pagr1aQ99L02 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pagr1aQ99L02 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pagr1aQ99L02 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pagr1aQ99L02 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pagr1aQ99L02 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pagr1aQ99L02 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pagr1aQ99L02 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pagr1aQ99L02 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pagr1aQ99L02 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pagr1aQ99L02 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pagr1aQ99L02 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pagr1aQ99L02 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pagr1aQ99L02 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pagr1aQ99L02 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pagr1aQ99L02 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Pagr1aQ99L02 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pagr1aQ99L02 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pagr1aQ99L02 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pagr1aQ99L02 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pagr1aQ99L02 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pagr1aQ99L02 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pagr1aQ99L02 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pagr1aQ99L02 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pagr1aQ99L02 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pagr1aQ99L02 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Pagr1aQ99L02 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pagr1aQ99L02 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pagr1aQ99L02 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pagr1aQ99L02 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pagr1aQ99L02 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pagr1aQ99L02 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pagr1aQ99L02 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pagr1aQ99L02 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pagr1aQ99L02 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pagr1aQ99L02 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pagr1aQ99L02 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pagr1aQ99L02 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pagr1aQ99L02 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pagr1aQ99L02 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pagr1aQ99L02 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pagr1aQ99L02 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Pagr1aQ99L02 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pagr1aQ99L02 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pagr1aQ99L02 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pagr1aQ99L02 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pagr1aQ99L02 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pagr1aQ99L02 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pagr1aQ99L02 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pagr1aQ99L02 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pagr1aQ99L02 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pagr1aQ99L02 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pagr1aQ99L02 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Pagr1aQ99L02 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pagr1aQ99L02 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Pagr1aQ99L02 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pagr1aQ99L02 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pagr1aQ99L02 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pagr1aQ99L02 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pagr1aQ99L02 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pagr1aQ99L02 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pagr1aQ99L02 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pagr1aQ99L02 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pagr1aQ99L02 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pagr1aQ99L02 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pagr1aQ99L02 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pagr1aQ99L02 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pagr1aQ99L02 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pagr1aQ99L02 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pagr1aQ99L02 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pagr1aQ99L02 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Pagr1aQ99L02 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms