Protein–RNA interactions for Protein: Q99246

Cacna1d, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, mousemouse

Predictions only

Length 2,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1dQ99246 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna1dQ99246 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna1dQ99246 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna1dQ99246 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna1dQ99246 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna1dQ99246 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1dQ99246 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1dQ99246 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1dQ99246 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna1dQ99246 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna1dQ99246 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna1dQ99246 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna1dQ99246 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna1dQ99246 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna1dQ99246 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna1dQ99246 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna1dQ99246 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna1dQ99246 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna1dQ99246 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna1dQ99246 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna1dQ99246 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna1dQ99246 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna1dQ99246 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna1dQ99246 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna1dQ99246 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna1dQ99246 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna1dQ99246 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna1dQ99246 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna1dQ99246 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna1dQ99246 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna1dQ99246 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna1dQ99246 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna1dQ99246 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna1dQ99246 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna1dQ99246 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna1dQ99246 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna1dQ99246 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna1dQ99246 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna1dQ99246 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna1dQ99246 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna1dQ99246 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna1dQ99246 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna1dQ99246 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna1dQ99246 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna1dQ99246 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna1dQ99246 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna1dQ99246 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna1dQ99246 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna1dQ99246 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna1dQ99246 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cacna1dQ99246 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cacna1dQ99246 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cacna1dQ99246 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna1dQ99246 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna1dQ99246 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna1dQ99246 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna1dQ99246 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna1dQ99246 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna1dQ99246 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna1dQ99246 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna1dQ99246 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna1dQ99246 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna1dQ99246 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna1dQ99246 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna1dQ99246 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna1dQ99246 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna1dQ99246 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna1dQ99246 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna1dQ99246 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna1dQ99246 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna1dQ99246 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna1dQ99246 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna1dQ99246 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna1dQ99246 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cacna1dQ99246 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacna1dQ99246 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna1dQ99246 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna1dQ99246 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna1dQ99246 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna1dQ99246 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna1dQ99246 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna1dQ99246 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna1dQ99246 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna1dQ99246 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna1dQ99246 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna1dQ99246 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna1dQ99246 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna1dQ99246 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna1dQ99246 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna1dQ99246 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna1dQ99246 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna1dQ99246 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna1dQ99246 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna1dQ99246 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna1dQ99246 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna1dQ99246 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna1dQ99246 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna1dQ99246 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna1dQ99246 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna1dQ99246 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms