Protein–RNA interactions for Protein: Q96EQ9

Prdm9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm9Q96EQ9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm9Q96EQ9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm9Q96EQ9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prdm9Q96EQ9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm9Q96EQ9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm9Q96EQ9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm9Q96EQ9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm9Q96EQ9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm9Q96EQ9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm9Q96EQ9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm9Q96EQ9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm9Q96EQ9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm9Q96EQ9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm9Q96EQ9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm9Q96EQ9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm9Q96EQ9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm9Q96EQ9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm9Q96EQ9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm9Q96EQ9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm9Q96EQ9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm9Q96EQ9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm9Q96EQ9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm9Q96EQ9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm9Q96EQ9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm9Q96EQ9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm9Q96EQ9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm9Q96EQ9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm9Q96EQ9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prdm9Q96EQ9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prdm9Q96EQ9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm9Q96EQ9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm9Q96EQ9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm9Q96EQ9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm9Q96EQ9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm9Q96EQ9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm9Q96EQ9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm9Q96EQ9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm9Q96EQ9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm9Q96EQ9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm9Q96EQ9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm9Q96EQ9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm9Q96EQ9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm9Q96EQ9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm9Q96EQ9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm9Q96EQ9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm9Q96EQ9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm9Q96EQ9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm9Q96EQ9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm9Q96EQ9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm9Q96EQ9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm9Q96EQ9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm9Q96EQ9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm9Q96EQ9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm9Q96EQ9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm9Q96EQ9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm9Q96EQ9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm9Q96EQ9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm9Q96EQ9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prdm9Q96EQ9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prdm9Q96EQ9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm9Q96EQ9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm9Q96EQ9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm9Q96EQ9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms